结直肠癌预后生存影响因素的分析及预测因子的探究

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第一部分转移性结直肠癌姑息性手术的生存获益分析及预后预测模型的构建目的:探讨转移性结直肠癌患者行姑息性手术切除原发肿瘤病灶的生存获益,并构建姑息性手术组与非手术组的预后预测模型。方法:回顾性分析美国国立癌症研究所“监测、流行病学和结果”(Surveillance,Epidemiology and End Results,SEER)数据库2010-2015年诊断为转移性结直肠癌患者的临床数据。通过倾向性评分法匹配两组患者(姑息性手术组与非手术组)的基线资料与临床肿瘤特征,以总生存率为评价指标,采用Kaplan-Meier分析法进行两组的生存率比较。首先比较两组未进行匹配前的生存率,之后对未匹配的因素按亚组进行分层分析,采用log-rank法进行两组间比较。应用单因素Cox回归对手术组以及非手术组进行影响预后的变量筛选,多因素Cox回归方法确定最终纳入模型的变量并构建预后预测模型,绘制列线图进行模型的可视化。使用一致性指数和校准曲线来评估预后列线图的预测性能。结果:根据纳入标准最终从SEER数据库获得21464例发生肝转移以及肺转移的结直肠癌患者。经过1:1倾向性匹配,共匹配7621对手术组与非手术组患者。匹配后两组患者的年龄、性别、种族、婚姻状况、肿瘤发生部位均无显著差异。Kaplan-Meier生存曲线显示在匹配前以及匹配后姑息性手术组患者的生存率均明显优于非手术组(P<0.05)。将未匹配的临床亚组特征进行分层分析后显示:在组织分化水平、化疗状态、T分期以及N分期的各分层中,姑息性手术组生存率均明显高于非手术组(P<0.05)。单因素及多因素Cox回归分析得出姑息性手术组纳入模型的独立预后因素有年龄、婚姻状况、组织学分级、肿瘤部位、检查的总淋巴结个数、阳性淋巴结率、T分期、N分期、癌胚抗原水平。非手术组的预后独立危险因素为:年龄、婚姻状况、肿瘤部位、组织学分级、CEA水平。列线图分别实现了两组预测模型的可视化,手术组预测模型的一致性指数为0.723(95%CI为0.686-0.764),非手术组为0.620(95%CI为0.586-0.676),手术组的校准曲线呈现良好的线性拟合度。一致性指数以及校准曲线显示手术组列线图的预后预测效能高。结论:姑息性手术为转移性结直肠癌患者带来生存获益,姑息性手术人群中构建的预后模型有较好的预测能力。第二部分肿瘤突变负荷在结直肠癌免疫治疗疗效预测作用中的机制探讨及免疫基因风险评分预后模型的构建目的:分析肿瘤突变负荷(Tumor mutation burden,TMB)在结直肠癌中的免疫特征,探讨其作为生物标志物预测结直肠癌免疫治疗疗效的机制。计算不同TMB组差异表达的免疫基因,并构建基于免疫基因标签的预后风险评分模型。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获得结直肠癌患者的基因表达谱数据、突变数据和临床资料。按TMB水平值为20个突变/Mb的截断值将样本分为高、低TMB组,鉴定两组的差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)。通过功能富集分析了解DEGs的生物学功能。利用基因簇富集分析(Gene set enrichment analysis,GSEA)富集工具分析高TMB组基因所富集的生物学过程。应用CIBERSORT算法计算高低TMB组免疫细胞特征并比较两组间免疫浸润细胞的差异。最后,将高低TMB组的差异免疫基因应用单因素和多因素Cox风险回归模型鉴定出与结直肠癌预后相关的免疫基因,并以此构建基于预后免疫基因标签的风险评分模型并对模型进行评价。进一步分析高低风险评分患者的生存状态以及与其他临床特征对生存的影响,确定风险评分作为独立预后因素的效能。结果:高、低TMB组的DEGs的功能富集分析结果显示:DEGs富集于免疫相关通路,如细胞因子-细胞因子受体相互作用、趋化因子信号转导、细胞粘附、Th17,T1和T2细胞分化、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、抗原加工与递呈。GSEA分析显示高TMB组基因同样在抗原加工与递呈、Toll样受体信号转导和自然杀伤细胞介导的细胞毒性等与免疫反应高度相关通路中富集。高低TMB组的免疫浸润细胞比较结果显示:高TMB组CD8+T细胞、CD4+T细胞、活化的NK细胞、M1巨噬细胞和T滤泡辅助细胞浸润水平显著高于低TMB组。最后,通过单因素及多因素Cox分析获得了AMH、DHX58、EPOR和TNFRSF19共4个预后免疫基因,基于4个免疫基因的表达水平构建了免疫基因风险评分预测模型并进行生存分析与模型评价。结果显示高风险评分组患者生存时间显著低于低风险评分组(P<0.05),风险评分模型的受试者工作曲线下面积为0.707。免疫基因风险评分与其他临床特征对生存影响的Cox回归分析显示风险评分是结直肠癌的独立预后因素(HR=3.53,95%CI=2.136-5.836,P<0.001)。结论:高TMB水平与结直肠癌的免疫特征显著相关。基于免疫基因标签构建的风险评分模型可作为结直肠癌预后的独立预测因子。
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