鼠疫耶尔森氏菌与假结核耶尔森氏菌比较基因组学研究

来源 :中国人民解放军军事医学科学院 | 被引量 : 1次 | 上传用户:xq111
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鼠疫是由鼠疫菌引起的烈 性传染病,同时鼠疫菌也是一种生物战剂。鼠疫的流行曾给人类带来巨大的灾难。目前,鼠疫虽得到有效控制,但世界卫生组织已将鼠疫列为重新抬头的传染病,并且鼠疫菌生物剂用于生物战和生物恐怖的可能性依然存在。因此,对鼠疫菌进行深入研究具有重要意义。 耶尔森氏菌属包括11个耶尔森氏菌种,其中鼠疫菌、假结核菌和小肠结肠炎耶尔森氏菌对人致病,其它种对人不致病。鼠疫菌与假结核菌非常近缘,它可能是在1,500-20,000年前由假结核菌株0∶1b进化而来。然而,鼠疫菌引起令人恐怖的鼠疫,而假结核菌仅引起肠道疾病。鼠疫菌比假结核菌多两个毒力质粒,这在一定程度上能解释它与假结核菌之间传播方式的不同。然而,两个毒力质粒的存在不足以解释鼠疫菌的特殊毒力。比较基因组学的方法有望阐明二者之间不同表型的分子机制。目前细菌比较基因组学的方法主要包括全基因组序列测定、全基因组芯片和抑制消减杂交等技术。利用全基因组序列进行比较基因组学研究无疑是最佳选择,但是,测定全基因组序列需要投入大量的人力和物力。细菌的不同生物型和不同分离株基因组之间存在着一定的差异。为比较它们之间的差异,不可能对每一株菌都进行全基因组序列测定,只能选择一些具有代表性的菌株进行。测定,因此这个方法显然不现实。目前已有三株鼠疫菌和一株假结核菌的全基因组序列测定完成,这为我们比较二者之间的差别提供了丰富的信息。另一个比较理想的比较细菌基因组的方法就是全基因组芯片。全基因组芯片要求包括基因组内所有编码序列,这样的工作量和花费的才力也是相当巨大的。抑制消减杂交技术是近几年发展起来的一种比较基因组的方法。它通过对两组基因组DNA进行比较筛选出差异序列,有效抑制相同序列的检出,主要检出差异序列,而且花费的人力和物力相对较低。因此,本研究主要目的是通过抑制削减杂交技术,筛选出假结核菌相对于鼠疫菌的差异序列,制备差异片段DNA芯片,用制备的芯片筛选多株鼠疫菌和假结核菌,希望找到二者之间具有代表性的差异片段,为正确认
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