马铃薯（Solanum tuberosum L．）是世界上第四大粮食作物，在我国和世界工农业生产中均占有重要地位。马铃薯的生产受到多种病虫害的制约，其中晚疫病影响最大。马铃薯晚疫病垂直抗性并不持久，因为新产生的Phytophthora infestans小种会迅速克服这种单基因抗性。而多基因控制的水平抗性属非小种特异性，具晚疫病水平抗性的马铃薯品种的抗性广谱、持久，选育水平抗性品种是当前马铃薯品种改良的重要目标之一。控制水平抗性的许多微效基因与病原和环境的复杂互作，以及马铃薯栽培种的四体性遗传使得选择十分困难。 本研究采用候选基因策略，在引自国际马铃薯中心的马铃薯晚疫病水平抗性材料B群体中筛选与晚疫病水平抗性显著相关的分子标记，并用于分子标记辅助选择。主要研究结果如下： 1．本研究从水平抗性材料B群体中随机挑选了122个株系，用P.infestans混合生理小种进行小叶离体鉴定。鉴定结果显示，122个株系的晚疫病水平离体病级趋于正态分布。 2．根据已报道的在马铃薯作图群体中已定位的分子标记，选择与晚疫病抗性QTL紧密连锁或源自NBS-LRR结构的标记，同时根据晚疫病水平抗性相关的EST等序列设计特异引物，对所选择株系进行标记检测。本实验共用38对候选基因特异引物进行简单PCR扩增。对扩增出的带型进行逐步回归分析表明，BA228d23₉₀，grol-2-P40₅₀₀，NL27₂₅₀，GP23₆₀₀，GP23₁₂₀₀，R×1₃₀₀，GP179₅₇₀，prp1₈₀₀8个标记与晚疫病水平抗性显著相关。 3．从已构建的富集晚疫病水平抗性相关基因的差减文库中筛选目标EST，据此设计特异引物。另根据LM-PCR的引物序列设计特异引物。将这些特异引物配合相应的随机引物对各株系进行优化的TRAP扩增。在扩增的带型中，1-1650，1-1360，2-1820，2-1380，3-1500，3-1380，3-480，5-1670，5-1300，5-1100，6-820，7-1180，7-640，8-1740，8-1360，8-260，9-420，14-1360，14-220，13-1360，13-1100，13-410与晚疫病水平抗性显著相关。 4．对与晚疫病水平抗性显著相关标记的辅助选择结果分析发现，多标记的选择效率优于单标记的选择。 5．本实验结果表明，在晚疫病水平抗性分子标记辅助选择中采用候选基因策略，可以高效率地筛选与水平抗性相关的分子标记。