在台湾政治转型的过程中，“台独”运动利用政治体制的开放在岛内迅速发展，而台湾政治转型前的二元政治体制为“台独”运动的发展提供了机会结构。“台独”运动正是通过理论论述与运动路线的不断调整与台湾政治转型相结合。在理论发展上“台独”运动与民主化、本土化相结合；在路线调整上，由暴力方式向和平方式演变，由“革命”路线向“民主”路线演变，由体制外路线为主，向体制内与体制外相结合，并以体制内为主的路线演变。本文以唯物史观为指导，运用历史研究方法和文献分析方法，制度主义的研究路径，对台湾政治转型中的“台独”运动理论与路线进行系统和全面的考察，揭示该时期“台独”运动理论和路线演变的特点，从而分析台湾政治转型对“台独”运动理论和路线演变的影响。文章分为五个部分： 导论，说明研究的缘起及意义，回顾和评介前人的学术成果，介绍本文运用的理论和研究方法。 第一章，从民主化和本土化的角度，论述政治转型与“台独”运动的相互关系。 第二章，考察台湾政治转型中“台独”运动理论和论述的发展，论述“台独”运动理论如何与政治转型中的民主化、本土化及具体政治形势相结合。 第三章，考察台湾政治转型中“台独”运动的路线演变，论述由于政治体制的开放和吸纳，“台独”运动路线在向“非暴力化”和“制度化”调整的基础上，加速与台湾民主政治制度相结合。 结语，总结和归纳全文，分析“台独”运动的理论和路线演变与台湾政治转型中的体制变革的密切关系。