以公共数据库为基础，通过自编过滤程序建立了以核酸为主的猪专门化分子生物学数据库。建立了中国地方猪品种资源数据库。在建立数据库的基础上，初步实现了数据库应用，包括核酸电子自动延伸系统、基于Web的本地化BLAST同源序列检索程序以及结构预测等。它将为建立猪的生物信息学研究平台打下基础。本研究的主要内容及结果如下： 1．建立了专门化的猪分子生物学数据库。序列数据库中以EST数据库和HTGS数据库为主。其中，猪的EST数据库中的记录量超过了10万。 2．建立了核酸序列电子自动延伸系统。对于猪cDNA序列可以进行有效、迅速的延伸。对于给定的psme1和psme2两条验证序列，该系统都进行了有效的延伸，得到了与RACE一致的延伸结果。 3．建立了基于Web的本地化BLAST同源比对程序。检索方式、参数选择、结果格式均与NCBI类似，便于进行交流。检索用数据库均由本研究建立。 4．建立了中国地方品种资源数据库。包括猪、马、牛、羊、禽在内的200多个中国地方品种被收入了数据库，涉及到地方品种的外貌、类型、典型特征等多个性状，为从事中国地方品种遗传资源的利用与保护提供了参考。 5．建立了以人为主的参照数据库。人基因注释数据库和蛋白质结构信息数据库是进行比较生物学研究不可缺少的部分，同时，蛋白质结构信息数据库将为猪基因的深入研究提供重要参考信息。 6．建立了猪生物信息学研究平台。可以对基因和蛋白质进行相关生物信息学研究，特别是对蛋白质三维结构的模拟，可以在蛋白质水平上直观的描述基因产物的特征，对于进行科研和教学具有一定价值。 7．建立了实验室生物学网站。可以通过互联网进行数据库的检索，提高了数据库的应用效率。网站的建设还可以为数据库的更新带来方便，也为本研究领域内的交流与合作起到桥梁作用。