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手足口病（HFMD）主要是由肠道病毒EV71和柯萨奇病毒CoxA16感染后而引起的一种急性传染病。由肠道病毒EV71引起的手足口病是全球性的传染病,从上世纪70年代末至今,已发生了数次大规模的流行。目前来看还没有一种药物被批准用于临床治疗,因此,发现和发展具有新颖结构的抗EV71病毒药物具有重要意义。VP1是EV71病毒表面衣壳的一个组成蛋白,是抗EV71小分子抑制剂研究的重要靶点。本论文基于VP1蛋白结构设计、合成一系列具有新颖结构的EV71小分子抑制剂。以台湾国立健康研究所设计的咪唑啉酮类化合物为模板,结合前期活性筛选发现具有抗病毒活性的托烷酸酐结构特征,通过对文献报道的高活性化合物的结构活性关系分析,运用经典药物设计理论,设计、合成了含3-（吡啶-4-基）四氢嘧啶-2（1H）-酮结构、托烷酸酐结构、2-巯基-5-苯基-1,3,4-噁二唑结构、N-（3-氯-4-甲基苯基）-N-（3-取代）-丙基苯甲酰胺结构的四类化合物。所有化合物结构经质谱、核磁共振（1H-NMR）确证。采用BrCr TR病毒株和RD细胞,通过细胞水平的体外药效学实验,测试了合成化合物抗EV71 BrCr TR病毒株的活性和细胞毒性。结果表明,3-（吡啶-4-基）四氢嘧啶-2（1H）-酮类化合物及托烷酸酐类化合物并未表现出明显的抗EV71病毒活性。含2-巯基-5-苯基-1,3,4,-噁二唑结构化合物表现出较佳的活性,其中化合物M7的IC50为0.74μg/mL,CC50为44.14μg/mL。根据不同结构类型的抑制剂结构中取代基的变化,构型改变等对活性的影响,初步分析了三类抑制剂的构效关系,结果表明:（1）设计化合物左侧结构为刚性五元环时,化合物活性较好。（2）化合物右侧片段结构对细胞毒性影响较大,当右侧片段为苄基哌嗪结构时,毒性较大。（3）2-巯基-5-苯基-1,3,4噁二唑类化合物中间碳链长度对化合物活性影响不明显。以上结论可为新一轮抗EV71病毒小分子抑制剂的设计提供理论依据。