截止到2018年5月,我国已经有4300万家中小企业,占企业总数99.3%,占GDP总量的55.6%,在整个国民经济的发展中,中小企业展现了巨大的市场活力,在优化资源配置、促进就业、扩大出口和提供个性化服务等方面,提供了巨大的动力和效益。国家重视中小企业的深层次发展,2015年发起设立的中小企业发展基金已经进入运营阶段,随着基金的发展我们的监管也必须同步推进,这就需要国家审计这一重要工具来发挥作用,以此作为评价工具来衡量基金运行的合规性和效益性。同时中小企业发展基金绩效审计作为公共政策活动的内生工具,以风险导向、结果导向为理念,强调政策方案执行效果的评定,对政策的制定与执行过程起到了反馈与监督的作用。然而目前中小企业发展基金审计主要采用财务收支审计方法,审计的内容和重点主要集中在基金设立程序是否合规,基金资金是否存在违规挪用的情况、资金支付是否及时等,并没有从制度、管理层面研究基金的绩效问题。论文前半部分从理论角度出发,介绍了中小企业发展基金的政策构成、中小企业发展基金审计的功能定位和中小企业发展基金绩效审计的相关文献,以新公共管理理论、公共受托责任理论和公共政策审计的“三维模式”这三个理论作为理论基础,结合中小企业发展基金审计的自身特性进行分析。接着,结合S市的具体审计案例,根据审计开展和实施的情况,对审计发现问题进行梳理并分析其问题背后的深层次原因。然后,从解决问题的思路出发,根据中小企业发展基金政策的意义与目标,结合美国的相关经验和具体方法并根据目标间的关联性,将中小企业发展基金绩效审计分为四个方向:中小企业发展基金设立情况、引导政策、资金管理、资金使用,在这个四个目标的基础上进行分析和构建形成完善路径。本文的创新点主要体现在以下方面:目前对于中小企业发展基金绩效审计研究处于初期探索阶段,本文在案例分析的基础上,结合我国目前关于中小企业发展基金的实践情况,为中小企业发展基金绩效审计实践提供参考思路。