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癫痫(epilepsy)是一种常见的神经系统疾病,人群患病率0.5~1%。目前倾向认为特发性癫痫是一种离子通道病。电压门控性钠通道在兴奋性细胞中发挥重要的作用,它选择性通透钠离子,参与动作电位的产生与传播。Nav1.1在动作电位发放的初始阶段起着重要的作用,而编码Nav1.1 α亚基的SCN1A基因与癫痫的发牛密切相关。目前已从全面性癫痫伴热性惊厥附加综合征(GEFS+)、顽固性儿童强直阵挛性癫痫(ICEGTC)、婴儿严重肌阵挛性癫痫(SMEI/Dravet Syndrome)和临界的SMEI(SMEB)等多种癫痫患者中发现SCN1A基因的点突变。在正常哺乳动物神经系统中,SCN1A基因的表达具有明显时空性。实验证明,SCN1A基因敲除鼠(+/-)出现癫痫发作,表明SCN1A基因的表达水平与癫痫密切相关,而基因的核心启动子及其上游调控区域对于基因的时空表达起关健作用。目前为止,SCN2A、SCN5A、SCNSA的肩动子区和基本特性已研究确定,而SCN1A基因的启动子区的研究还没有报道。本实验的目的是克隆SCN1A基因的5’侧翼区片段,初步确定SCN1A基因核心启动子及其上游调控序列,利用生物信息学预测肩动子区的顺式作用元件及反式作用因子,并观察SCN1A基因表达的组织特异性。
方法:
提取正常人外周血基因组DNA作为模板,利用7对引物进行PCR反应,获取SCA1A基因5’侧翼区不同长度的片段:P1(-1~-4897 bp),P2(-1~-2985 bp),P3(-1~-2392bp),P4(-1~-1936 bp),P5(-1~-1688 bp),P6(-1~-1479 bp)和P7(-1480~-4897bp)(起始密码子ATG的第一个字母设为+1)。将上述片段克隆到pGL4.10载体,构建荧光素酶报告基因系列重组质粒:pGL4-P1~pGL4-P7。将上述重组质粒和内参照质粒pRL-TK共同转染SH-SY5Y细胞和HEK293细胞,然后利用双荧光检测系统检测各质粒转染细胞裂解液的相对荧光活性(Fpn/Ftk)。确定SCN1A基因核心肩动子所在的区域后,比较SCN1A基因启动子在不同类型细胞中的转录活性,并利用生物信息学软件预测肩动子区的顺式作用元件及反式作用因子。
结论:
1,初步确定SCN1A基因核心启动子位于-1479~-1688bp区段内。
2,SCN1A基因启动子活性与细胞类型有关,在神经组织特异性细胞(SH-SYSY)中具有活性,而在其他组织细胞(HEK293)中没有活性。
3,预测得到27个SCN1A基因启动子区顺式作用元件及反式转录因子。