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浮游动物是海域中分布较为广泛的类群之一,其种类及其数量众多,繁殖能力极强,在海洋生态系统以及食物网中占据重要部位。首先,他们作为次级生产者参与生态系统物质循环与能量流动;此外,浮游动物对污染物很敏感,有积累和转移作用,因此其种类数量,群落变化等也是监测海洋生态毒理、海水环境和水系的重要指标。因此浮游动物的研究在渔业资源和生态环境调查中占据重要地位。目前,浮游动物的研究多偏向于生态学研究,遗传进化方面的研究开展相对缓慢。长腹剑水蚤属(Oithona)作为海洋中小型桡足类最为丰富的类群之一,在海洋生态系统中同样具有重要的研究意义。目前对长腹剑水蚤的分类鉴定主要依据形态学数据为主,由于个体小且形态差异微小,通过传统的形态学分类法对其进行准确鉴定难度较大,并且形态学的鉴定会存在主观的偏差性,会造成鉴定的误差。另外,由于长腹剑水蚤不能做远距离游动,因此不同海域的种类间存在地理隔离,产生生殖隔离,这使得长腹剑水蚤属内存在隐种的分化,更加增大了形态鉴定增加的难度。目前,长腹剑水蚤的系统进化关系尚未明确,严重影响了长腹剑水蚤的深入研究。本研究通过对长腹剑水蚤进行系统进化研究,揭示长腹剑水蚤属的进化关系,并且为种类鉴定提供分子数据。我们将本实验所得数据与GenBank中长腹剑水蚤属其他地区种类的基因序列进行比较分析,使用ABGD(Automatic Barcode Gap Discovery)和GMYC(Generalized Mixed Yule Coalescent)模型进行物种界定,并构建贝叶斯和最大似然法系统进化树。本研究的结论主要是以下几个方面:1.基于mtCOI基因序列,利用ABGD和GMYC模型对长腹剑水蚤进行物种界定,界定结果与形态学分类一致。说明了mtCOI基因可作为标记基因对长腹剑水蚤进行种类鉴定,这为以后种类鉴定提供了分子数据。2.mtCOI基因的均转换/颠换(si/sv)数为1.44,转换数略高于颠换数,且主要发生在第三位点。18S rDNA基因序列的平均转换/颠换(si/sv)值为2.96,要比mtCOI基因序列的要高,这与其基因的保守性有关。3.两种基因的碱基组成有各自的特点。COI基因序列中A:24.5%,G:18.4%,C:19.4%,T:37.6%,其中A+T(62.1%)含量明显高于G+C(37.8%)含量。而18S rDNA基因序列的各碱基组成基本相同,不存在碱基偏异性,碱基组成分别为A:26.0%,T:25.5%,C:21.5%,G:27.1%。18S rDNA相对于mtCOI基因序列具有较高的保守位点和较低的变异位点和简约信息位,表现出较低的进化速度,具有较高的保守性。4.mtCOI基因序列的种间遗传距离为17.7%-44.5%,表明长腹剑水蚤种间遗传差异已经达到属间的分化范围。结合形态学数据将长腹剑水蚤属拆分为两个属。但基于18S rDNA基因序列的遗传距离范围为1.1%-5.1%,各种间显示出较近的的亲缘关系。这说明长腹剑水蚤属内各种间的18S rDNA序列差异很小,呈现出18S rDNA的保守性。5.mtCOI基因的贝叶斯和最大似然法系统进化树结果显示,长腹剑水蚤存在隐种的分化,分别出现于不同海域的拟长腹剑水蚤(O.similis)与羽长腹剑水蚤(O.plumifera)内。在18S rDNA系统进化树中,羽长腹剑水蚤(O.plumifera)与刺长腹剑水蚤(O.setigera)归为一支,介于羽长腹剑水蚤和刺长腹剑水蚤在体型上相似,两者可能具有较近的亲缘关系。同时也说明18S rDNA更适用于较高的分类阶元。