十株海洋亚历山大藻ITS区序列测定和对比分析

来源 :中国科学院大学(中国科学院海洋研究所) | 被引量 : 0次 | 上传用户:hxlatxx
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本文使用分子生物学实验方法,对来自中国东海海域、南海大鹏湾、香港海域、台湾省海域等地的 10 株海洋亚历山大藻(Alexamdrium)进行特异性 PCR扩增,获得由核基因编码的核糖体基因内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer, ITS)DNA 片段,经测序得到 10 个序列的信息。利用分子生物学软件,对这些序列及选自 GenBank 的 11 个代表性亚历山大藻株 ITS 序列进行比对分析,计算了序列间的距离值,绘制了分子系统树,对序列进行了相似性研究,并且推论出株藻间亲缘关系的远近;同时发现原先鉴定为 A.minutum AM 的藻株可能是一株A.tamarense。实验中,8 株藻采用了传统的 DNA 提取方法获得 PCR 扩增模板,2 株藻尝试藻液 10 分钟预处理后直接扩增的办法,成功建立了一种经济、快捷获得目标 PCR 产物的新方法。
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