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目的:为了解云南省2014-2015年肾综合征出血热(Hemorrhagic Fever with Renal Syndrome,HFRS)流行现状、宿主动物及疫源地分布特征,为HFRS的监测及防控提供科学依据。方法:HFRS疫情资料来自于云南省疾病预防控制中心传染病疫情报告系统,用EXCEL2010、SPSS17.0以及EpiInfo7.0进行数据分析。用直接免疫荧光法检测汉坦病毒抗原,病毒核酸用RT-PCR进行检测,病毒序列用DNAstar、Clustal1.83和MEGA6.06进行分析。结果:2014-2015年云南省共报道HFRS病例510例,2014年发病率0.52/10万,2015年发病率0.56/10万。大理州和楚雄州为高发地区,夏季和秋季是发病的主要季节,发病人群主要是中年和老年的男性农民。对HFRS高发地区的253例病例进行了个案调查,临床表现:以乏力、发热和头痛为主;临床常规实验室检查不能对HFSR病例作出诊断;农村HFRS的疫苗普及率低,未发现人传人的HFRS病例;多数病例的感染途径不明。2014-2015年间,在云南省怒江州的贡山县、泸水县和楚雄州的大姚县共捕获小型哺乳动物351只,其中304只进行免疫荧光检测,阳性108份,阳性样本再进行核酸检测,得到核酸阳性样本19份,阳性率为17.59%。其中2份最接近阿西卡拉型病毒(Asikkala virus,ASIV),核苷酸同源性从63.5%-79.7%,宿主动物皆为高山鼩鼱(Sorex minutus);1份属于汉城型汉坦病毒(Seoul virus,SEOV),宿主动物为针毛鼠(Niviventer fulvescens);12份未分型汉坦病毒(Hantavirus,HV)(最接近YN06-1024株),其中11份宿主动物为大绒鼠(Eothenomys miletus)和1份为长尾鼩(Soriculus salenskii);4份未分型HV(最接近YN05-484株),宿主动物皆为短尾鼩(Anourosorex squamipes)。结论:2014-2015两年为云南省自监测HFRS以来发病例数和发病率最高的年份,夏季HFRS的防控更为重要,中老年男性农民是防护的重点人群。临床一般实验室诊断不能对HFRS作出诊断。云南省HV的宿主动物存在生物多样性,同时,宿主动物携带的HV也存在遗传多样性。HV在云南宿主动物的感染存在跨种传播的现象。云南的宿主动物,特别是食虫动物,携带有新型的HV。