我国环境公益诉讼程序是内嵌于传统诉讼法的“组装程序”,立法上存在诸多不足:程序规范分散于多部法律和司法解释而不成体系;程序内容与传统诉讼法不兼容而产生较多矛盾;环境公益诉讼程序作为司法制度属于法律绝对保留事项,应通过制定法律来构建,我国“立法原则规定、司法具体构建”的模式有违反《立法法》关于法律保留的规定之嫌。另外,在司法实践中,环境公益诉讼程序与传统诉讼程序存在诸多差异,已无法为传统诉讼程序所涵盖和包容。本文基于法律文本和司法实践的视角,对环境公益诉讼程序运行现状进行分析,提出环境公益诉讼程序专门化命题,以期完善环境公益诉讼程序制度。文章首先从环境公益诉讼这一基本概念切入,分析环境公益诉讼的特征和类型,继而提出环境公益诉讼程序专门化命题、明确研究对象,为全文论述奠定基础。其次通过检视剖析我国环境公益诉讼程序运行现状,揭示现行程序在立法和司法中存在的不足。再次在宏观维度从弥补立法不足、回应司法实践需求、彰显环境法律价值三个方面论证环境公益诉讼程序专门化的必要性,从法理依据、历史经验、现实基础三个方面论证环境公益诉讼程序专门化的可行性。最后从中观维度和微观维度提出环境公益诉讼程序专门化的构想方案,即从基本原则、路径选择、顺位设计的中观维度明确环境公益诉讼程序专门化的指导思想和价值追求、指明实现专门化的路径,从诉讼主体制度、管辖制度、预防性司法和恢复性司法的微观维度就具体制度方面提出合理建议。