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本研究以枯草芽孢杆菌B006为研究材料,针对生产中连作造成的黄瓜枯萎病菌Fusarium oxysporum f. sp. cucumerinum (Foc)大量累积而引起的枯萎病问题,通过对生防菌B006在黄瓜根际产生的脂肽类抗生素的检测和枯萎病菌种群数量的监测,探讨抗生素的产生与枯萎病菌数量、生防菌数量及病害发生之间的关系。明确该问题对深入理解生防枯草芽孢杆菌B006在田间状况下的防病机理有重要的意义。研究结果表明：枯草芽孢杆菌B006发酵液的甲醇提取物对黄瓜枯萎病菌菌丝的抑制作用大于对辣椒疫霉病菌Phytophthora capsici菌丝的抑制作用；但对P. capsici游动孢子萌发的抑制作用明显大于对黄瓜枯萎病菌孢子萌发的抑制作用,提取物原液在5min内可使辣椒疫霉的游动孢子全部崩解。HPLC-ESI-MS分析发酵液提取物中可检测到m/z为995、1009、1023、1037、1051和1436、1450、1478和1492的质谱峰,与抗菌物质surfactin和fengycin的分子量大小一致。以终浓度为106cfu.g-1的接种量将生防菌B006菌剂施入无菌育苗基质中,在黄瓜4-6片叶期时用固相萃取法提取根际的抗菌物质,并进行HPLC-ESI-MS分析,证明可在根际检测到surfactin和fengycin,但未从对照处理根上检测到脂肽类抗生素。本研究在前人的研究基础上,建立根际土壤中生防菌B006和黄瓜枯萎病菌KW2-1的荧光定量PCR监测体系,生防菌B006的最低检测限为7.80E+01cfu.g-1,黄瓜枯萎病菌KW2-1的最低检测限为2ng·-1。田间防病实验结果表明：在添加生防菌B006的基质中育苗,对黄瓜的出苗率和株高没有显著的影响；在育苗基质中添加生防菌B006,同时移栽时生防菌灌根处理可降低根际枯萎病菌数量和枯萎病的病情指数；生防菌两次灌根处理能够有效防治穴施有机肥病土中的黄瓜枯萎病的发生,生防菌B006的定殖量高于对照组1个数量级,枯萎病菌KW2-1数量比对照处理明显降低,延后发病期2周左右,在移苗5周时防效达到58.5%；穴施有机肥对根际黄瓜枯萎病菌KW2-1的种群数量影响不明显,没有显著的防治效果优势。对根际脂肽类抗生素的种类与含量进行检测,结果表明根际生防菌B006和枯萎病菌KW2-1的种群数量与脂肽类抗生素的产生量没有明显的相关性；穴施有机肥的处理,根际脂肽类抗生素surfactin的量高于其它处理。