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菌株DietziamarisAS-13-3是本实验室从印度洋深海热液区沉积物中分离到的一株砷抗性菌,具有在烷烃诱导下产生物表面活性物质的能力。在以正十六烷为唯一碳源的MSM培养基中生长良好,并且能将发酵液的表面张力从62.0±1.0mNm-1降低到33.0±1.0mNm-1。研究发现,菌株D.marisAS-13-3产生的表面活性物质为糖脂。菌株D.marisAS-13-3产生的糖脂经过硅胶柱层析、凝胶柱层析和高效液相制备后得到纯品,纯品经过LC-MS、NMR等手段进行分析和鉴定,结果表明菌株AS-13-3产生的糖脂的主要成分为双鼠李糖脂(Rha-Rha-C10-C10),分子量为650,能够将水的表面张力从74±0.2mNm-1降低到38±0.2mNm-1,其临界胶束浓度值(CMC)为120mg/L。
此外,本文还对菌株D.marisAS-13-3的烷烃降解能力和重金属抗性进行了研究。研究发现菌株D.marisAS-13-3能够以中等链长(C10-C22)的直链烷烃和支链烷烃Pristane为唯一碳源生长。在碳源初始浓度为1%(V/V)、培养时间为10天(28℃)的条件下,通过GC-MS测定菌株D.marisAS-13-3对于烷烃的降解率。实验结果表明菌株AS-13-3对于C14、C16、C18和Pristane的降解率分别为79.59%、60.06%、35.46%和22.87%。另外,研究还发现菌株D.marisAS-13-3对Zn2+、Mn2+、Co2+、Ni2+、Cu2+、Cr6+均有一定抗性,是一株多种重金属抗性菌,尤其是对Cu2+的抗性较强,其最低抑制浓度(MIC)达到8mM。
为了深入研究菌株D.marisAS-13-3对于环境胁迫因子(如重金属、烷烃和寡营养)的适应性机制和产表面活性剂的代谢合成及调控机制,我们对菌株AS-13-3的基因组进行测序,并且对测序后的基因组进行分析。分析结果表明,在菌株D.marisAS-13-3的基因组中存在与其他种属微生物相类似的鼠李糖脂合成的代谢途径,基因组中同时也含有烷烃降解的关键基因-烷烃羟化酶,包括AlkBRd融合蛋白和P450单加氧酶;还有和砷抗性相关的ars操纵子和铜抗性相关的copZA以及类似于copYZAB的操纵子。这些功能基因的发现,一方面解释了菌株AS-13-3所表现出来的表型,另一方面加深了我们对于这些生物学现象的理解和认识。
综上所述,深海热液区来源菌株D.marisAS-13-3具有良好的烷烃降解能力和产双鼠李糖脂表面活性剂的能力,同时还具有多种重金属抗性。因此,菌株D.marisAS-13-3可能在石油及重金属污染的生物修复有较大的应用潜力。