农业作为国民经济的基础,一直都是“三农”问题中的重要一环。2020年中央一号文件明确要求,必须确保重要农产品供给,保质保量完成高标准农田建设任务。农业因其生产的特殊性,自然风险与市场风险并存,是典型的高风险“弱质行业”,农业的重要性和特殊性共同决定了我国农业发展离不开财政资金的支持。农业综合开发作为中央在“三农”工作部署中的重头戏,在提高农业综合生产能力和综合效益方面发挥了重要作用。资源的稀缺性和环境约束决定了提升农业综合生产能力必须紧紧依靠农业全要素生产率的增长,农业综合开发的成效与作用是否会直接或间接作用于农业全要素生产率增长,成为一个值得研究的问题。本文在梳理相关学者研究成果的基础上,结合公共财政理论和农业投资理论,分析了农业综合开发发展现状及投资情况,采用DEA-Malmquist指数法对2003-2017年我国农业全要素生产率及其构成部分增长率进行了测算,最后选用一阶差分GMM估计方法从农业综合开发的投资规模、资金来源结构、资金投入项目结构三个方面展开,实证农业综合开发投资与农业全要素生产率增长之间的关系。研究发现:我国农业全要素生产率年均增长率为8.6%,呈现农业技术进步和技术效率改善双轮驱动的良性格局,农业全要素生产率增长的区域差异逐渐缩小,呈现“西部略高,中东部稍低”的分布特点。农业综合开发投资能够显著促进农业全要素生产率增长,其中农业综合开发投资每增加1%,农业全要素生产率增长率将提高0.06%。具体来看,在农业综合开发资金来源结构中,财政资金能够显著促进农业全要素生产率的增长,其弹性系数为0.16,自筹资金和银行贷款的作用不显著;在资金投入项目结构中,农业综合开发土地治理项目能够通过提高农业技术进步进而显著促进农业全要素生产率增长,土地治理项目投资每增加1%,农业全要素生产率增长率将提高0.206%,产业化经营项目投资未能显著影响农业全要素生产率提升,但对农业技术效率改善有促进作用。在控制变量中,农村用电量、对外开放程度和人力资本的发展显著地促进了农业全要素生产率提升,而城镇化则在一定程度上抑制了农业全要素生产率增长,工业化进程、农业结构调整系数对农业全要素生产率增长影响则不显著。根据研究结论,本文得到如下政策启示:第一,扩大农业综合开发投资规模,形成稳定增长机制;第二,拓宽农业综合开发资金融资渠道,优化资金来源结构;第三,深化土地治理项目,推进土地适度规模经营;第四,完善项目建设管理机制,提高资金利用效率。