一株传染性胰腺坏死病毒基因组序列分析及反向遗传操作系统的建立

来源 :上海海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ilovegigi
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
传染性胰腺坏死病(Infectious Pancreatic Necrosis,IPN)是由传染性胰腺坏死病毒(Infectious Pancreatic Necrosis Virus,IPNV)引起的一种主要危害鲑鳟鱼苗的高致死性疾病。自上世纪八十年代传入中国至今仍没有有效的防控药物,而由于毒株存在变异及安全因素,国外商品化疫苗无法直接引进及应用。本课题组于2013年IPN暴发期间在中国云南省某虹鳟养殖场分离到一株IPNV强毒(命名为ChRtm213)。本文对该毒株的全基因组序列进行了测定与分析,并在此基础上利用反向遗传操作技术构建了重组IPNV病毒(rChRtm213)。本研究对全面了解IPNV的结构与功能、揭示IPNV致病与免疫的分子机制等相关的研究具有重要意义。本研究利用逆转录聚合酶链式反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)方法,从IPNV-ChRtm213细胞培养物的总RNA中获得了ChRtm213基因组片段并进行了序列测定,与GenBank中IPNV序列进行了比对,并运用软件对其进行生物信息学分析。序列分析结果表明,ChRtm213毒株的全基因组序列包含一个A链(3099 bp)编码多聚蛋白VP2-VP4-VP3,和一个B链(2789 bp)编码一个RNA依赖的RNA聚合酶VP1蛋白。系统发育分析表明,ChRtm213属于基因1型,血清型为A9(Jasper),和日本IPNV毒株AM98具有最高的同源性,其中A链与B链相似性分别为96.3%和97.3%。本研究通过In-Fusion无缝连接的方法成功构建了以T7 RNA聚合酶介导的IPNV高效反向遗传操作系统。分别在ChRtm213株A、B链上引入分子沉默性标签并将其克隆在真核表达载体(NDV vector)的T7启动子下游,构建了ChRtm213-NDV-A和ChRtm213-NDV-B重组质粒,然后通过LipofectamineTM2000(Invitrogen)介导,与表达T7RNA聚合酶的真核表达载体共转染CHSE-214细胞,转染后96 h利用新的单层CHSE-214继续扩增。通过噬斑纯化鉴定、电镜观察、间接免疫荧光检测、酶切分子标签检测证明了重组IPNV的存在。本研究成功构建了IPNV高效反向遗传操作系统。该系统具有稳定、简便等特点,能在CHSE-214上高效获得重组病毒。
其他文献
本文针对城市供电系统中供电网络的电容电流的测量和消弧线圈调节控制补偿后的电网电压电流的测量问题,设计了一种可同步采集数据的ISA总线的计算机接口卡,可同时采集几十路
利用空芯电流互感器和电光晶体实现了工频电流的光学传感与测量,对工频电流一电压变换方法和二次电压的光学传感进行了理论与实验研究.结果表明,这种方法具有线性和同相位传感特
多分力载荷传感器是一种常用的传感器,但通常当各分力的量程相差太大时难以取得良好的效果。提出了一种新型传感器结构形式,减少了各分力之间的耦合,使得在各分力量程不匹配的情
本文以大连獐子岛近岸海域典型海草床大叶藻为研究对象,采用形态学、实验生态学和生理生态学等方法,初步了解了獐子岛近岸海域典型海草场的海草种群,研究了獐子岛海域典型海草场
本文综述了国内外有关缺氧对鱼类生理生态学影响以及鱼类对缺氧的适应方式的研究进展,采用实验生态学、生物能量学及生理学等方法,开展了低溶解氧(DO)对褐牙鲆幼鱼生长、补偿
本研究以凡纳滨对虾为对象,研究了在养殖水体中添加芽孢杆菌与甘蔗渣后养殖池水质变化、芽孢杆菌在池塘中的数量变化以及对虾的养殖效果。主要研究结果如下:1添加甘蔗渣养殖凡
分析云南省建水县甸尾乡的自然条件、地理环境、自然资源,参照马铃薯标准技术规程,阐述马铃薯的培育从育苗、整地、选种、田间管理管理、病虫防治等多方面所采用的技术、措施
养殖池塘水体和底泥的特征微生物群落与其栖息的生态位的环境条件相适应,并且行使特殊的生态功能。研究微生物群落结构和他们的生态功能可以帮助我们理解池塘不同营养盐的生物地球化学循环过程和它们在原位的关联。由于有大量的外来有机碳(C)和有机氮(N)输入,C和N营养循环在池塘生态系统中尤其重要。为了更好地理解池塘中N素的地球化学循环过程,降低氮污染物对养殖对象的危害,调控氮素更多地流向水产品,我们调查了池塘
今年是五四运动90周年。怎样认识五四运动的历史地位?怎样评价民主与科学口号的意义及其内涵的历史演进?怎样评价五四时期反对封建文化思想的斗争?怎样继承和发扬五四运动的历史传统?带着这些问题,本刊记者于近日采访了北京大学教授、中央马克思主义理论研究与建设工程“中国近现代史纲要”教材课题组首席专家、召集人沙健孙。
鳀(Engraulisjaponicus)是黄海生态系统的关键种。对鳀资源的准确评估是对它进行科学养护的基础,也是对黄海生态系统进行监测和研究的需要。渔业资源的声学评估是20世纪60年代