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目的:利用SSH技术筛选出hTERT基因的相关基因,从而寻找出与hTERT基因相关的转录调控因子以及转录调控通路,为深入研究hTERT基因的激活与调控机制打下基础。随着hTERT转录激活机制的逐渐明确,必将进一步明确端粒酶在正常和肿瘤细胞中的激活机制,从而为靶向端粒酶的肿瘤治疗和肿瘤药物的研发提供理论依据。
方法:利用SSH技术对hTERT沉默的hela细胞株进行筛选,以未处理的hela细胞株cDNA为tester,以hTERT沉默的hela细胞株cDNA为driver,进行正向消减杂交;以hTERT沉默的hela细胞株cDNA为tester,以未处理的hela细胞株cDNA为driver,进行反向消减杂交,得到hTERT沉默后的下调(或阻遏表达)和上调(或诱导表达)的两个cDNA基因文库。将文库中的部分基因片段进行生物信息学分析,初步对差异基因进行功能分类。利用半定量RT—PCR以及实时定量PCR进一步验证由SSH技术获得的差异片段是否真正代表了hTERT相关的基因。
结果:⑴利用SSH技术得到了hTERT沉默后的下调(或阻遏表达)或上调(或诱导表达)的两个cDNA基因文库。通过消减效率分析表明,两个文库中的管家基因GAPDH均被消减了近1024倍。因此,SSH技术可用来寻找hTERT沉默后的相关基因。⑵对两个基因文库中的部分基因进行生物信息学分析,初步建立了hTERT相关基因功能表达谱。发现hTERT相关基因功能涉及新陈代谢、能量、转录、蛋白合成、蛋白质活性调控、细胞通信及信号转导、细胞防御与毒性、环境相互作用、细胞命运、器官分化等方面。⑶对部分差异基因进行半定量RT—PCR以及实时定量PCR分析,发现在hela细胞和hTERT沉默后的hela细胞中这些基因的表达量确有差异。因此,消减杂交成功,可进一步作为hTERT的相关基因进行研究。
结论:①SSH技术可用来寻找hTERT沉默后的相关基因。②利用SSH技术成功构建了两个cDNA基因文库,可进一步作为hTERT的相关基因进行深入研究。③两个cDNA基因文库分别有73个和102个阳性克隆,其中随机选择20个克隆和16个克隆进行测序,初步建立了hTERT相关基因表达谱,为深入研究hTERT基因的激活与调控机制打下基础。