目前系统分析的应用主要是针对股市微观分析进行，而无法同时把握和处理股市中微观、中观与宏观关系。具体地说，即是现有股票市场理论主要是简单地应用系统分析思想与方法进行简单的股票选择和组合投资研究，其难以对股市系统进行整体而合理的分析。针对上述问题，本文从宏观、中观和微观角度（通过系统内、系统边界面和系统环境分析）对股市做了系统分析，并在文中提出了一种新型的股市系统分析指标体系——股市系统分析指标网以及一种表单运算法进行股市宏观、中观和微观的综合运作。最后对股市系统从股市要素、边界面和环境的共同运作的角度进行了探讨。具体来说，本文主要可分为四大部分：一是股票市场的简介；二是从游程分析的角度来对股市系统做的分析，从沪、深、港三市的游程分析比较中我们可以确定所要面对的股市的有效性，从而使后面的分析有了现时的基础；三是从微、中观（内含宏观）角度对股市系统做的分析，在这一部分中，主要进行的是对股市微观运作的基于事件和时间两种模拟的结合和中观分析中运用基于因果关系修正的相关关系来进行趋势分析，用以确定股市中相对较小部分结构的运动与环境的关系；在这些分析之后，又从股市系统分析的发展观方面对股市系统分析做了探讨和展望，主要是从股市系统、环境与边界面共同运作角度提出了一种新型的股市系统分析模型。