当前,我国财政科技投入管理步入了公共财政管理新时期,正在经历着一场宏观指导思想到微观经济技术方法等诸多方面的深刻变革。科学合理地定位财政科技投入在市场经济环境中的作用,有效支撑国家科技战略意志布局和实施,同时进一步引导和调动社会R&D投入的积极性,完善我国政府财政科技投入和市场科技投入的双体系建立与发展,成为重要研究课题。因此,借鉴国外典型科技发达国家财政科技投入的管理政策、模式和经验,研究提出适合我国现有科技生产力发展水平的财政科技投入配置政策和模式,对于进一步提高我国财政科技投入管理效率,进一步提高我国科技综合竞争力水平具有重要意义。本文从财政科技投入的理论研究入手,首先评述了国内外有关研究的现状,发现既有研究存在不系统性和不完整性,尤其缺乏对我国现有经济发展和科技投入新历史条件下和公共财政框架建立初期的理论与实践、定性与定量的研究。随后,本文对国内外相关研究进行了综合性评述,综合分析了典型国家国立科研机构的组织管理模式和运行机制。在此基础上研究指出,其经费配置模式,可归结为3种：以国家需求为导向、基于项目的经费配置模式；倡导科学自治、基于人的经费配置模式；以及以市场为导向、外争经费匹配模式。这些经费配置模式各具特点,适用于不同定位、不同传统的科研机构。然后,本文详细介绍和分析了美国、英国、德国、法国和日本5个典型科技发达国家的科技管理政策沿革、政府科技投入管理体系和模式、政府科技投入及R&D支出的总量、结构、变化特点和规律,以及它们所实施的绩效评价。本文指出,从典型科技发达国家政府科技投入发展历史看,都经历了政府科技投入主导型、政府与企业科技投入双体系型和企业科技投入主导型3个发展阶段,其中政府科技投入随着国家经济工业化发展水平的不断提高,从全面投入支持各类科技活动逐步转变为重点支持具有公共产品属性的科技活动,主要体现在基础研究领域和基础科技条件建设,将科技活动中竞争性、利益明显归属性的部分交给市场调节,同时辅以相应的优惠政策。在此基础上,本文基于科技投入产出多元化的客观特点,选取了科技投入产出中最具代表性的指标,构建了绩效评价指标体系,并利用DEA方法设计了绩效评价模型,即基于生产可能集规模收益不变假定的DEA模型(CCR-DEA)、基于生产可能集规模收益可变假定的DEA模型(BCC-DEA)和超效率DEA模型。利用3种模型计算相对效率,进行了分别排序,发现近年来中国在3种模型超效率已经与典型科技发达国家的超效率接近甚至是超越,2008年的排序是第2位。该结果印证了我国现行的科技投入管理模式与现有科技生产力发展水平总体上相适应。最后,本文以我国公共财政框架建设为背景,进一步分析和梳理了我国现行财政科技投入管理中的典型问题及成因,提出了有关建设符合公共财政管理机制的若干建议,对进一步改进公共财政新形势下的财政科技投入管理具有一定的参考价值。