我国是乙型肝炎的高流行区，但是乙型肝炎病毒(HBV)基因型在我国大陆广大地区的分布尚未明了，HBV基因型的临床相关关系以及分子生物学特征也未见系统报道。本研究使用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)基因分型以及克隆测序方法，对我国大陆地区9个省市1096例慢性乙肝病毒感染者血清样本进行了大规模调查。结果发现在我国大陆地区流行的HBV基因型有A、B、C、D四种，所占比例分别为1.2％、39.3％、50.2％、8.1％。各地区的HBV基因型分布也大不相同。在北方地区，以基因型C为主，占81.6％；南方则以基因型B为主，基因型C也占相当比例。两种主要的基因型B和C的临床特征比较发现，感染HBV基因型B的人群平均年龄较感染基因型C者小：随年龄增长，基因型C在感染人群中所占比例逐渐增加。在年龄大于30岁的感染者中，感染基因型C者e抗原阳性率显著高于基因型B组。两组之间在肝功能改变、临床诊断以及病理变化评估方面未见有统计学差异。序列分析显示我国HBV基因型B毒株均为具有基因型C特征前C/C基因重组体。本研究基本阐明我国大陆地区HBV基因型地理分布；提示尽管基因型B较基因型C可能有较早的e抗原清除，两者之间临床结局并无显著差异，这可能与在中国地区流行的基因型B均为与基因型C前C/C重组体有关。 此外，本文还利用计算机软件，对HBV基因型间P基因特点进行系统的分析，为进一步研究HBV基因型、P基因变异与病毒复制及核苷类似物耐药的关系提供参考。对GeneBank中已发表的202株HBV全序列及P基因进行分析比较发现：HBV P基因在各基因型具有自身特点。在反转录酶(rt)区，基因型A氨基酸的型内差异较小，基因型C、D氨基酸的型内差异较大；在rt区A-F六个高度保守区域，也发现在基因型间及型内存在氨基酸水平的差异。这些结果提示：(1)P基因及其氨基酸存在基因型间和型内异质性，因而分析某些氨基酸差异是与耐药有关还是准株被选择的结果，应综合考虑在该位点是否存在基因型间或型内的氨基酸差异；(2)对核苷类似物抗病毒治疗应答以及治疗中耐药现象的发生在HBV不同基因型可能不同。