谶纬在清代之前屡被禁毁,虽在明代有学者对其专门进行辑佚,但并未形成规模。进入清代以后,谶纬作为清人研究汉代学术、思想不可回避的一部分,成为清人辑佚和研究的对象之一,而官修类书《渊鉴类函》则成为清代谶纬文献辑佚的序曲,为清代后来谶纬文献的辑佚和研究提供了宝贵的文献资料。朱彝尊的《经义考·毖纬》虽不是专门辑佚谶纬文献,但朱彝尊以《古微书》为底本,在此基础上,搜集了众多谶纬文献的资料,具有重要的文献参考价值,也拉开了清代学者个人辑佚谶纬的序幕。《古今图书集成》作为现存规模最大的一部类书,其谶纬内容虽然不多,但《古今图书集成》的编者充分注重了谶纬的解经之用,而这也成为清代学者辑佚和研究谶纬的指导思想之一。清初的谶纬辑佚为后人进行谶纬辑佚奠定了良好的基础,不仅条目的名称、数量基本确定,而且谶纬的内容也有了大体的框架。因此,清朝中期以后,在明孙毂《古微书》的基础上,清代出现了专收谶纬文献的著作,殷元正辑、陆明睿增订的《纬书》、赵在翰《七纬》与顾观光《七纬拾遗》、刘学宠的《诸经纬遗》、乔松年的《纬搐》等。清代其他收谶纬文献成果较大的著作,则有武英殿聚珍本《易纬》、《玉函山房辑佚书》、《玉函山房辑佚书续编》、《汉学堂知足斋丛书》、《汉学堂丛书》、《黄氏逸书考》等。而谶纬作为汉代经学和思想的重要组成部分,自然也就成了清代学者复兴汉学所不能忽视的内容。随着谶纬资料的日益增多,清代学者们对谶纬进行了探讨和研究,尤以清人学术笔记为代表。清代学术思想的形成与演变直接影响了清人的谶纬观及谶纬在清代的发展、演变及影响。清代学术思想主要分为清初学术思想、乾嘉学术思想及晚清学术思想,而清人的谶纬观及谶纬的发展演变在各个时期也各具特色。谶纬虽具有一定的迷信色彩,但谶纬却也有一定的文献价值,谶纬虽兴于汉时,但谶纬与我国的上古文化也有着密切的关系,从谶纬文献中我们可以看到上古诸神在谶纬中的演变,包括神的形象、职务等,由此我们也可对我国上古诸神在时间上的演变做出一些推论,而谶纬文献中所保存的大量的有关古代祭祀的条文,对研究我国古代的祭祀文化有重要的意义。