本文基于自主创新战略的视角,研究我国多层次资本市场的建设问题。本文认为,完善的多层次资本市场可以拓宽企业自主创新的融资渠道,也可以保证创业风险投资的有效退出,因而多层次资本市场体系具有独特的支持创新的功能。但目前我国资本市场的结构不完善,导致自主创新企业融资难问题。　　因此,本文根据自主创新企业在不同发展阶段具有不同融资需求的特点,通过建立自主创新企业、风险投资市场与一般资本市场的联动机制,从实现三者完美互动的角度,构建一个相互对接、互补互动的多层次资本市场体系,具体内容包括主板、中小企业板、创业板、代办股份转让系统、产权交易市场和天使投资市场六个层次。　　在上述基础上,本文进一步认为,在研究多层次资本市场推动自主创新、服务于自主创新战略的同时,也要重视多层次资本市场自身的市场创新。而市场创新不仅体现在新市场的构建上,也体现在对原有市场的改进上。因此,本文还详细阐述了我国资本市场在市场理念、市场制度、交易技术和交易产品等方面应进行的创新。　　最后,在前文论述的基础上,本文针对各市场存在的问题,给出发展各子层次市场的一些政策建议。