随着生态文明战略地位的提升，如何提升基层政府环境保护水平并科学衡量其环境绩效是已成为环保学者关注的焦点问题。我国经济快速增长与资源、环境矛盾冲突日益加剧的状况，与政府在经济、社会与环境协调发展工作中重视不够、履职不力有直接的关系。在实践中，基层政府重经济发展轻环境保护现象时有发生，传统的政府环境行政职能存在管理不力、低效率的缺陷，迫切需要树立科学的发展观和政绩观，转变片面追求经济增长及“以GDP论英雄”的发展观和政绩观，并加快转变政府职能。本文以生态文明、可持续发展、政府绩效评估理论为基础，归纳国内外有关政府环境绩效评估实践，从评估目的、主体、客体、指标、标准、方法等方面系统构建了县级政府行政首长环境绩效评估体系，借鉴施行的环保考核标准与方法提出环境质量、环境监管、环境建设、环境满意4个方面13个评估指标。在此基础上，分别以S、J、N3县级市政府为案例研究对象，进行了县级政府行政首长环境绩效评估的实证研究。通过实证研究，指出现行的环境保护评价标准和要求尚有优化提升空间，如施行环境空气质量新标准等；评估主体尚未实现多元化，如未规范采集环境满意方面指标等；评估结果尚未真正促进环境保护管理水平的改进与提高，并未真正影响领导干部的使用等一系列现实问题。论文最后从深化基础理论研究、强化评估实证研究、拓展评估应用研究三个方面对县级政府行政首长环境绩效评估工作进行了展望。县级政府行政首长环境绩效评估既是对县级政府领导干部政绩的考核，更是对县级政府宏观决策、环境管理体系、环境投入等一系列活动效率效果的监督。通过施行县级政府行政首长环境绩效评估，可促使基层政府领导干部在经济建设过程中更多地从环境保护角度出发，切实发挥环境行政的职能和作用，增强践行生态文明能力，提升科学发展水平。