结直肠癌中相关分子:Occludin、PHF14以及KIF4A的变化与功能研究

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目的:结直肠癌是当今最常见的恶性肿瘤之一,目前更完善的早期干预措施已成为结直肠癌发病率降低的直接因素,同时也有效地降低了结直肠癌患者的死亡率。为进一步从分子机理上更好的理解结直肠癌的发生发展,我们对筛选出的紧密连接蛋白Occludin、人源Plant Homodomain(PHD) finger蛋白PHF14以及驱动蛋白超家族蛋白KIF4A进行了初步的研究,通过蛋白质组学、分子生物学、细胞生物学的研究方法初步分析了这三个分子与结直肠癌的关系。方法:我们利用荧光实时定量PCR分析了结直肠癌中标本中Occludin、PHF14以及KIF4A在mRNA水平上差异,并运用统计学方法寻找与临床资料的相关性;用WesternBlot以及双向电泳初步验证在结直肠癌中Occludin的表达在蛋白水平上的差异。此外我们也通过培养结直肠癌细胞株SW620和CaCo2,观察Occludin的变化是否影响结直肠癌细胞株的细胞形态。结果:结直肠癌标本中,Occludin在mRNA水平上普遍下调,在肿瘤组织中约是正常组织中的63%,并且Occludin的低表达与患者是否存在便血显著相关(P=0.011),同时,Occludin与APC的表达也存在着正相关(P<0.01);在蛋白水平上,我们进一步验证了Occludin的低表达,并且发现在正常组织中存在的某种特定修饰或特定同源异构体在肿瘤组织中普遍缺失,且该缺失在肿瘤性息肉中并不出现。细胞生物学实验并没有观察到Occludin影响结直肠癌细胞株的形态。另外,55例结直肠癌样本的荧光实时定量PCR分析并未发现PHF14在mRNA水平上的表达异常,并且其表达水平与临床因素无相关性;而KIF4A在肿瘤中mRNA水平上明显高表达,大约是正常组织的2.8倍,并且在女性结直肠癌患者以及肿瘤组织直径≦5cm的结直肠癌患者中,其高表达更为明显(P=0.046*,P=0.044*)。结论:Occludin具有潜在的抑癌基因的作用,它在结直肠肿瘤组织中不但表达下调,还有特殊的缺失存在,但目前仍不能确定Occludin是否影响结直肠癌细胞株的形态或其他生物学功能;不同于Occludin,在结直肠癌中PHF14在mRNA水平上并没有显著的变化;另外,KIF4A在结直肠癌中明显高表达,预示着它具有潜在的原癌基因的特性。目的:病人组织样品是临床医学研究的宝贵资源,极其珍贵。临床组织样品量获得十分有限,往往在毫克(mg)级。病人的遗传和病理生理变化信息都蕴含在样品的DNA、RNA和蛋白质各种变化之中。由于获取组织来源DNA、RNA和蛋白质方法和原理差异,目前,同时提取高质量DNA、RNA和蛋白的技术方法仍不成熟。在此我们改进了传统TRIzol法,以至能从微量组织样品中提取高质量RNA并同时提取基因组DNA和总蛋白。方法:我们用改良后的TRIzol法提取小鼠肝脏组织总RNA、基因组DNA以及总蛋白,并与传统TRIzol法提取总RNA、商业化试剂盒提取基因组DNA和RIPA裂解Buffer提取总蛋白的方法进行比较。结果:改良TRIzol法提取小鼠肝组织RNA的平均得率为3.64μg/m g,传统TRIzol法为1.95μg/mg,平均OD值分别为2.1和2.01;改良Trizol法能够得到比传统Trizol法更完整的RNA,琼脂糖电泳图谱中28S/18S的比值更接近2:1。改良TRIzol法与商业试剂盒相比,提取所得的基因组DNA尽管在得率上有较明显差距,分别为0.49μg/mg和1.78μg/mg,但仍保持较好的纯度。改良TRIzol法提取所得蛋白的平均得率为RIPA Buffer裂解法的50-60%,经过SDS-PAGE电泳和考马斯亮蓝染色法验证,并无明显蛋白丢失。结论:改良TRIzol法可以同时提取组织的总DNA、RNA与总蛋白,相比传统TRIzol法提取总RNA更高效、质量更优;相比商业化试剂盒提取基因组DNA更快捷、更经济;相比RIPABuffer裂解法提取总蛋白在小分子蛋白的保留中更好。该方法可以尽可能的为我们节省组织标本量,不失为在样品组织较少的情况下最佳的选择。
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