人骨肉瘤组织环状RNA的初步筛选

来源 :南华大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:zhengyicai2010
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目的:本研究旨在通过高通量测序技术和生物信息学方法,筛选出人骨肉瘤组织中差异性表达的环状RNA,为本研究小组下一步探索人骨肉瘤侵袭与转移的分子机制奠定基础。方法:选取5例骨肉瘤患者新辅助化疗前病检组织的中心部位骨肉瘤组织(实验组),选取5例人正常软骨组织(对照组),分别提取总RNA。然后通过高通量测序技术和生物信息学方法,筛选出差异性表达的环状RNA,预测微小RNA,再对差异环状RNA来源基因行KEGG生物通路分类及富集化分析。结果:1.实验组和对照组对比研究发现,在筛选出的差异性表达环状RNA中,表达上调的环状RNA 61337个,表达下调7132个,只在实验组人骨肉瘤组织中表达的环状RNA有59655种,只在对照组人正常软骨组织中表达的环状RNA有3316种,两组中共同表达的环状RNA有5498种。2.研究发现hsacirc0001445、hsacirc0006988、hsacirc0000246在人骨肉瘤组织中表达显著上调,hsacirc0009043、hsacirc0072309、hsacirc0001185显著下调。对环状RNA的来源基因进行富集分析,筛选出49条信号通路具有显著差异。结论:1.在本研究5例人骨肉瘤组织中,共筛选出显著差异性表达的环状RNA 6个,即hsacirc0001445、hsacirc0006988、hsacirc0000246显著上调,hsacirc0009043、hsacirc0072309、hsacirc0001185显著下调。2.本研究发现泛素介导的蛋白水解信号通路、AMPK信号通路、鞘脂信号通路以及胰岛素信号通路与骨肉瘤的发病密切相关,磷脂酰肌醇信号通路可能与人骨肉瘤的转移有关。
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