LncRNA在云南宣威地区肺癌家系中的表达及临床关联分析

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:sheen
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[背景与目的]肺癌的发病率和死亡率居高不下,云南宣威地区肺癌发病率和死亡率远高于国内其他地区,这与当地燃煤污染密切相关,且发病呈现出明显的家族聚集性。本研究旨在探究长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)与宣威地区家族肺癌之间的潜在联系,为宣威地区肺癌遗传易感性研究及早诊早治提供理论依据和实验基础。[方法]在前期宣威地区肺癌患者的家族癌症病史进行调查,及家系肺癌代表性患者全基因组测序(Genome Wide Association Studies,GWAS)数据分析的基础上筛选出高频率突前十的长链非编码RNA,针对其中高频率的突变位点设计引物。通过qRT-PCR技术检测目标LncRNA在不同非小细胞肺癌患者癌及癌旁正常组织中的表达水平;在非小细胞肺癌细胞系A549、NCI-H1299、H1650、HCC-827和人正常支气管上皮细胞系BEAS-2B中验证目标LncRNA的表达情况;分析在肺癌组织中表达差异明显的关键LncRNA与非小细胞肺癌患者临床病理特征的相关性,为明确LncRNA在非小细胞肺癌的进一步诊断、治疗研究中提供理论和实验依据。[结果]1.在宣威肺癌家系基因组中交集分析突变频率前十的LncRNA:Linc00842、Linc00343、Linc00507、Linc00433、LincC00578、Linc00544、Linc00320、Linc00624、Linc00665、Linc00871。2.Linc00665、Linc00624、Linc00320在57例非小细胞肺癌组织和人非小细胞肺癌细胞株表达明显上调,差异有统计学意义(P<0.05);Linc00842在癌组织和人非小细胞肺癌细胞株中表达明显下调,差异有统计学意义(P<0.05)。3.相关性分析结果提示:Linc00665在癌组织中高表达与长期居住地区、肿瘤病理类型有关,在肺腺癌患者和宣威地区肺癌患者中其高表达,而在肺鳞癌及其他病理类型以及非宣威地区肺癌中低表达,差异有统计学意义(P<0.05);Linc00320在癌组织中高表达与淋巴结转移有关,在淋巴结转移阳性患者中其高表达,而在淋巴结转移阴性患者中其低表达,差异有统计学意义(P<0.05);Linc00624高表达与患者临床病理特征无明显关联。4.Linc00665、Linc00624、Linc00320、Linc00871、Linc00343、Linc00507 在A549、NCI-H1299、NCI-H1650、HCC-827 细胞中较 BEAS-2B 细胞表达上调,而 Linc00842、Linc00578、Linc00544 在 A549、NCI-H1299、NCI-H1650、HCC-827细胞中较BEAS-2B细胞表达下调。[结论]1、Linc00665、Linc00624、Linc00320、Linc00842 可能与非小细胞肺癌发生发展有关。2、Linc00665和Linc00320可能成为非小细胞肺癌诊断、治疗相关的新生物学标志,且Linc00665在非小细胞肺癌差异性表达对宣威地区家系肺癌的进一步研究提供新的思路。
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