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深海具有各种极端环境特征,包括温度、压力、pH等,生存在深海的微生物具有适应这些环境的能力,因此目前深海微生物已成为筛选各种特殊资源的热点。 邻苯二甲酸酯(Phthalates esters,PAEs)类化合物是大宗工业品,主要作为增塑剂添加在各种工业产品中,随着这些商品扩散到环境中,具有环境雌激素的危害,引起了国际社会的广泛关注。中国也已经将邻苯二甲酸二甲酯(DimethylPhthalate,DMP)、邻苯二甲酸二乙酯(Diethyl phthalate,DEP)、邻苯二甲酸二辛酯(Dioctyl Phthalate,DOP)这三种常见的PAEs确定为优先控制的环境污染物。目前对于PAEs的化学降解研究已有不少报道,但在生物降解方面仍有很多工作要做。研究发现每年约有数百万吨塑料垃圾流入海洋,因此本文利用深海原位富集的方式从深海样品中开展了PAEs降解微生物的研究。 采用非培养和培养的方法,对深海原位富集获得的DMP降解菌群进行了分析。在菌株分离筛选方面,为有效获得可降解DMP的菌株,原位富集时用吸附了DMP的活性炭作为载体,取样后在实验室中再用DMP作为唯一碳源摇瓶驯化四周。筛选到的细菌经16S rRNA基因鉴定分别属于6属10种,均具有良好的降解性能。原位样品涂2216E平板(2S组)、原位样品涂含DMP平板(DS组)、摇瓶驯化后涂2216E平板(Y2S组)、摇瓶驯化涂含DMP平板(YDS组)这四组中YDS组的菌群的降解能力最为突出,表明驯化对于目标菌株筛选的重要作用。在非培养分析方面,提取原位富集所获得菌群的总DNA,利用PCR建库的方法对其中的16S rRNA基因进行了测序和分析,结果表明DMP降解菌群中变形菌门占了最大比例达到97.1%,其次是厚壁菌门占了0.017%,其它分类的占2.9%。 对一株疑似新种进行了鉴定,其16S rRNA基因经数据库比对与其他已知物种的16S rRNA相似性为96.83%,经过表型特征、生理生化特征、遗传学特征等分类鉴定,将其命名为Pelagibaca nanhaius sp.nov.D13T,并同时完成了该菌的全基因组扫描图并分析了数据。获得了该菌株降解DMP的羧酸酯酶的基因,降解邻苯二甲酸酯的一些特殊代谢途径等。