食蟹猴和中国恒河猴TRIM5α不同等位基因抑制HIV-2ROD/SIVmac239复制关联性研究

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TRIM5α是灵长类动物基因中决定疾病易感性和发病速度的重要因素,是在天然免疫、体液免疫和细胞免疫等层面上抑制病毒复制起关键性作用的因素之一。之前在印度恒河猴中研究发现,TRIM5α基因多态性对病毒复制有影响。随着印度恒河猴出口的限制,中国恒河猴和食蟹猴已成为非常重要的医学实验动物,越来越多的被应用于艾滋病的研究。但是,目前关于中国恒河猴TRIM5α基因多态性与病毒易感性的关系还不清楚,也没有任何关于食蟹猴TRIM5α基因多态性与病毒易感性的相关报道。另外,之前课题组在39只越南起源食蟹猴群体TRIM5α中鉴定到决定病毒复制能力的339-340这两个关键位点氨基酸缺失突变率为97.5%,表明这两个氨基酸缺失已经在越南起源食蟹猴群体的TRIM5α基因中固定下来,接下来的问题是:在进化过程中,缺少了TRIM5α两个至关重要的功能性氨基酸的这些食蟹猴群体,他们如何应对HIV/SIV选择压的作用?是否存在另外的TRIM5α功能性位点以应对这些逆转录病毒的感染?为了阐明上述这些问题,本研究在课题组已有基础上上,利用40只食蟹猴和68只中国恒河猴群体来鉴定TRIM5α等位基因多态性,解析这两种猕猴群体TRIM5α的遗传背景。并通过HIV-2ROD/SIVmac239病毒体外感染特定TRIM5α不同等位基因型的两种猕猴外周血单个核细胞(PBMC),进一步深入分析这些等位基因与HIV-2/SIV易感性的关系,以阐明TRIM5α功能域在病毒复制中的作用及可能机制。经过分析,本研究得出的结果如下:(1)TRIM5α基因多态性鉴定:在40只食蟹猴和68只中国恒河猴群体TRIM5α基因的4号外显子和8号外显子中共鉴定到20个SNP位点。其中在食蟹猴群体中鉴定到16个SNP位点,组成10种单倍型,14种基因型。其中包括1个高频单倍型,在群体中的比例高达61.25%;1个低频物种特异性单倍型;以及1个高频等位基因型,在群体中的比例为40%。研究发现,随机挑选的40只食蟹猴群体在位于B30.2(SPRY)结构域的339-340两个氨基酸位点均发生缺失突变,缺失突变率为100%,与之前课题组在39只越南起源食蟹猴群体中鉴定到339-340两个氨基酸缺失突变率为97.5%的结果相符,表明这两个氨基酸缺失已经在越南起源食蟹猴群体的TRIM5α基因中固定下来。在中国恒河猴中共鉴定到9个SNP位点,组成9种单倍型,24种基因型。其中包括1个高频单倍型,在群体中出现的频率达28.68%,中国恒河猴群体基因型分布比较平均,没有鉴定到高频等位基因型。研究发现,随机挑选的68只中国恒河猴在B30.2(SPRY)结构域中鉴定到的A333S、TFP339-341ΔΔQ、S422L这3个变异位点是连锁遗传的。(2)TRIM5α不同等位基因与HIV-2/SIV易感性分析:我们在中国恒河猴TRIM5α的B30.2(SPRY)的功能域中发现,A333S、TFP339-341ΔΔQ、S422L这3个多态位点连锁在一起形成的单倍型可能对HIV-2ROD病毒复制有极显著影响。其中SΔΔQL纯合个体和比ATFPS纯合个体具有更高的病毒载量,对HIV-2ROD更易感。在第3、5、7天不同中国恒河猴实验个体培养上清中的病毒载量检测结果经统计学分析后,P值分别为0.002,0.004,0.019。此外,我们在食蟹猴的Coiled-coil功能域发现一个的多态位点Y178H,可能影响TRIM5α蛋白对HIV-2ROD的限制作用,同时该位点被报道能够影响TRIMCyp的表达和稳定。另外,中国恒河猴TRIM5α的Coiled-coil功能域中E222K和E236D两个多态位点可能能够影响SIVmac239病毒的活性,然而却没有在食蟹猴中发现与SIVmac239病毒相关的多态位点。基于这些结果,我们认为食蟹猴的TRIM5α基因多态性对SIVmac239病毒没有影响,但是会对HIV-2ROD的限制作用有影响;而对于中国恒河猴的TRIM5α基因多态性,不同的结构域可能对限制不同的病毒起不同的作用。
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