研究目的:在我国全面建设创新型国家的背景下,以微观企业为切入点调研江苏省医药制造业原始创新能力和协同创新能力的现状,从细分行业和地区两个分类,测算江苏医药制造业原始自主创新效率,分析对于江苏医药制造业原始创新能力具有显著性的影响因素,从知识溢出和吸收能力的角度评价江苏医药制造业产学研协同创新能力。综合评价江苏省各医药制造业创新能力并根据创新能力情况划分不同类型,针对性地反映各类型行业和地区的存在问题,提出江苏省医药制造业创新能力的路径与政策建议。对象与方法:针对2012—2015年江苏医药制造业的微观经济数据,从细分行业和地区两方面,使用基于DEA方法的两阶段SBM模型和Malmquist指数模型分析评价其原始自主创新能力效率以及发展趋势,并根据其技术创新效率和成果转化能力两方面建立原始创新技术效率矩阵将行业和地区分为A、B、C、D四类,运用Tobit回归分析医药制造业原始创新能力的外部影响因素;运用主成分分析法对江苏医药制造业的协同创新能力进行评价并采用计量经济学中的面板数据回归方法分析产学研协同创新过程中的影响因素。研究结果:(1)江苏省医药制造行业技术开发阶段的技术效率呈现波浪式的上升,峰值在2014年技术效率;成果转化阶段的技术效率普遍高于技术开发阶段且较为稳定。化学药品原药制造和兽用药品制造这两个行业原始创新效率相对于其他行业较强,中成药制造也始创新效率相对于其他行业较弱。泰州、镇江、南通等地区原始创新的两个阶段都保持了较高的技术创新效率,淮安、盐城两阶段的创新效率较低;(2)市场结构、企业所有权结构以及企业规模三个因素对江苏医药制造业整体的原始创新能力影响较大;(3)泰州、连云港、常州保持了较高的产学研协同创新能力水平,宿迁、镇江等地的知识溢出效应不明显技术吸收能力不强使得这些地区整体的协同创新能力较弱;(4)研发人员数量和对研究机构的投入因素对苏中地区的协同创新能力影响较大,苏北地区与国内高校的科研协作对企业创新产值的促进效应最大,苏南地区医药企业与境外研发协作对创新能力提升最明显。政策建议:(1)组织领导方面:加强原始创新与协同创新的立法工作,深化改革完善贯彻落实有关创新优惠政策,建立健全高校、科研机构与企业间的沟通协调组织机构,发挥医药行业协会等社会组织的社会服务功能。(2)体制机制创新方面:构建激发医药制造业创新长效机制、医药产业创新系统培育机制、吸引高层次医药研发人才引导机制,形成基于不同创新形式的税收优惠平台。(3)具体措施方面:选择创新效率的有效提升路径、推动医药产业集聚;建立良性竞争的市场环境,适度扩大医药企业规模;加强对引进技术的消化吸收能力、有效激励研发人员创新积极性;加强地区间人才流动,建立和完善研发人才引进、培养机制;改善协同创新网络组织模式;建立符合江苏医药制造业特点的跨区域产业集群协同创新系统。