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本文以三疣梭子蟹（Portunus trituberculatus）4个野生群体（鸭绿江口、莱州湾、舟山、海州湾）为材料,采用生物形态学性状多元分析技术、同功酶电泳技术、扩增片段长度多态性（Amplified Fragment Length Polymorphism, AFLP）技术,对三疣梭子蟹的遗传多样性进行了研究,对其种质资源状况进行了客观评价,并通过相关分析和通径分析找到了影响体重的主要形态学性状。主要结果如下:通过对4个野生群体的三疣梭子蟹14项生物学外部形态性状的测量,采用多元分析方法对其进行比较分析。聚类分析结果表明:海州湾、舟山2个群体形态最为接近,首先聚为一组,鸭绿江口和莱州湾2个群体形态较为接近聚为另一组。对样本所属群体进行判别分析,4个群体雌蟹的综合判别率为87.0%,其中海州湾最低为80.0%;莱州湾最高为92%。4个群体雄蟹的综合判别率为80.8%,其中海州湾最低为72.0%,鸭绿江口最高为96%。建立4个群体各自的判别函数公式。通过对16项形态比例参数单因素方差分析,找到了4个群体间存在显著差异的形态比例参数。3种分析结果均显示,4群体三疣梭子蟹在形态上已产生一定程度的差异,但所有的差异均未达到亚种水平,需要多项参数综合判别才能将4个群体的三疣梭子蟹区分开来。采用聚丙烯酰胺不连续凝胶垂直电泳技术对三疣梭子蟹4个野生群体的同工酶进行检测,分析群体间的生化遗传差异。结果发现:（1）4个群体的多态座位百分数（P0.99）分别为鸭绿江口20%、莱州湾20%、海州湾25%、舟山20%。（2）4个群体间的生化遗传差异不显著,4个群体间的遗传距离D=0.001450.01179,属种内群体间差异。（3）鸭绿江口、莱州湾、舟山群体和海州湾群体在ADH同工酶表型上有明显差异,前面3个群体此酶为一个基因座位单态,而后者为一个基因座位多态。（4）聚类分析表明4个群体分为两组,海州湾和舟山两群体之间的亲缘关系最近,聚为一组。莱州湾和鸭绿江口群体亲缘关系比较近聚为另一组。采用AFLP技术对三疣梭子蟹4个野生群体进行了遗传分析。每个群体随机取样30个,5对AFLP引物获得115个位点。其中鸭绿江口多态位点比例（P0.99）43.69%、Shannon多样性指数（H′）0.1501;莱州湾群体多态位点比例（P0.99）44.34%、Shannon多样性指数（H′）0.1577;舟山群体多态位点比例（P0.99）43.93%、Shannon多样性指数（H′）0.1450 ;海州湾多态位点比例（P0.99）41.35%,Shannon多样性指数（H1′）0.1559。4个群体之间的遗传差异有89.06%是来源于群体内,只有10.94%是来源于群体间。聚类分析表明:4个群体分为两组,海州湾和舟山两群体之间的亲缘关系最近,聚为一组。莱州湾和鸭绿江口群体亲缘关系比较近聚为另一组。通过对4个野生群体的三疣梭子蟹14项生物学外部形态性状的测量,选取了其中13项数据采用相关分析和通径分析方法,计算了以12项形态性状为自变量对体重作依变量的相关系数、通径系数、决定系数及相关指数,定量地分析了形态性状对体重的影响效果。结果表明,三疣梭子蟹12个形态性状均与体重的相关系数达到极显著水平（P<0.01）;通径分析揭示了多元分析中多个自变量与依变量的真实关系。全甲宽、甲长、体高、第一侧齿间距、第二侧齿间距、大螯不动指长对体重的通径系数达到显著水平。所选形态性状与体重的复相关指数为R2=0.8826,说明影响体重的主要自变量指标已经找到;多元回归分析建立了全甲宽（X1）、甲长（X2）、体高（X4）、第一侧齿间距（X5）、大螯不动指长（X7）对体重（Y）的回归方程,为三疣梭子蟹育种提供理论依据。