现代资本结构理论的发展将公司资本结构与公司治理紧密联系起来，资本结构是企业治理众多协调与控制机制中一个十分重要的控制机制。商业银行作为一种金融企业，同样需要建立一个有效的治理机制，以保证所有者对银行的控制，同时使经营者获得激励。商业银行的资本结构既具有一般企业的基本特征，又具有区别于一般企业的行业特性。以企业资本结构理论为指导，结合商业银行资本结构的行业特性，本文首先从银行股东的控制与股权结构治理效应和银行债权人控制与债权结构治理效应两方面对银行业资本结构治理效应作了一般性分析。之后本文重点对我国商业银行资本结构治理效应作以具体分析。我国商业银行经过近半个世纪的发展形成了当前以国有独资商业银行为主体、以上市股份制商业银行为发展方向的商业银行体系，因而对我国商业银行的分析可以以上述两类银行为代表。先以八家商业银行财务报表提供的数据为基础，分别分析两类银行不同的所有权结构特征和基本相同的债权结构特征；在此基础上对两类银行不同的所有权结构以及相同的债权结构的治理效应再分别作以分析。最后综合以上分析，从优化银行自身资本结构和优化银行外部治理环境两个方面提出优化我国商业银行治理效应的具体对策。