甜瓜果柄长度QTL位点的初步分析

来源 :黑龙江八一农垦大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:aaaaaaaazzzz
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甜瓜(Cucumis melo L.),葫芦科(Cucurbitaceae)甜瓜属(Cucumis L.)一年生蔓生植物。近年来随着甜瓜栽培面积的不断增加,产业化生产规模不断扩大,但是我国蔬菜生产成本也逐渐增加,尤其是大量人力物力的投入,造成较大的经济投入,“用工难”“用工贵”、机械化程度低是制约甜瓜规模化生产的重要因素。因次,设施栽培的规模化、机械化作业是甜瓜绿色生产上的一个的必然趋势。甜瓜果柄长度的研究对甜瓜机械化采收及提高生产力具有十分重要的意义。长果柄甜瓜一方面能够更好的利于机械化采收,提高机械化采收的准确率,另一方面更有利于甜瓜套袋,提升果实的外观和品质的同时还可以降低农药的残留,防止甜瓜的表面因药剂刺激而出现黄色斑点,影响甜瓜的商品性。本研究利用长果柄甜瓜1244和短果柄甜瓜MS-5杂交,配置杂交组合,获得F1、及F2分离群体,通过调查田间果柄长度分布规律,利用SLAF-seq测序技术构建甜瓜遗传图谱,分析果柄长度QTL位点的候选染色体,再利用较大F2群体结合SSR分子标记,对果柄长度性状QTL主效基因进一步定位,挖掘与甜瓜果柄长度相连锁的SSR分子标记,以期为甜瓜分子标记辅助选择育种提供理论基础,研究结果如下:1.对种植的甜瓜子蔓第五节位果柄长度进行调查并统计,结果显示F2群体果柄长度符合数量遗传分布,但出现了偏正态分布的双峰分布,偏度的绝对值大于0.5,推断甜瓜果柄长度性状存在主效基因。2.利用SLAF-seq(Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing)技术对甜瓜F2群体115个单株开展遗传图谱构建,利用Hpy166 II酶切组合方案进行酶切,SLAF标签长度选择264414 bp,预测到112,844个SLAF标签。通过对标签进行筛选和分型构建遗传连锁图谱,获得包括10,595个标记,图谱总长1,383.88cM的遗传连锁图谱,标记之间的平均距离0.13cM。初步得到到两个与甜瓜果柄长度相关的QTL分别为fsl1.1和fsl8.1,分别分布在第1和第8连锁群上。fsl1.1初步定位到LG1连锁群的;fsl8.1初步定位到LG8连锁群。3.利用已发表的SSR引物,在甜瓜第1和第8连锁群上每隔5cM选择一对SSR引物,最终筛选获得140对SSR引物,其中36对在亲本间存在多态性,分子标记的多态性频率为25.71%。以SLAF-seq测序技术定位甜瓜果柄长度候选区间为基础,利用该区间内具有多态性的SSR分子标记,以390个单株的F2群体为材料,对果柄长度QTL进行进一步定位分析,并挖掘与其连锁的SSR分子标记。结果显示,位于第1条染色体上fsl1.1,位于CMSSR05887和CMSSR05892之间,LOD值为4.2,表型贡献率为12.2%,加性效应为-0.24,QTL候选区间位于scaffold00060 57524至270836之间,该区间内共检测到20个基因;位于第8条染色体上fsl8.1,位于CMSSR20549与CMSSR20495间,LOD值为4.4,表型贡献率为13.2%,加性效应0.5,QTL候选区间位于CM3.5.1scaffold00058 94748至105498之间该区间内共检测到167个基因。
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