多重实时荧光定量PCR检测猪呼吸与繁殖障碍疾病相关病毒研究

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近年来,伴随着养殖业的快速规模化发展,猪呼吸与繁殖障碍疾病已成为影响养猪业健康发展最重要疾病之一。猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type2, PCV2)、猪细小病毒(Porcine parvovirus, PPV)、伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus, PRV)、猪繁殖与呼吸综合症病毒(Porcine productive and respiratory syndrome virus, PRRSV)、猪瘟病毒(Classical swine fever virus, CSFV)、日本脑炎病毒(Japanese encephalitis virus, JEV)是引起猪呼吸和繁殖障碍疾病的主要病原,它们常常呈混合感染,病情十分复杂,死亡率高,造成的经济损失严重。因此,能对多种猪病毒的快速检测具有重要意义。本研究建立的一种基于Taqman多重实时荧光定量PCR方法,可有效检测出这六种病毒。  本研究首先建立了六种猪病毒的单重实时荧光定量 PCR体系,PCV2,PPV,PRV,PRRSV,CSFV和JEV这六种猪病毒的扩增效率分别达到98%,99%,93%,97%,97%和95%;各单重实时荧光定量PCR对非靶病毒均无非特异性扩增,对六种病毒的检测灵敏度均为5 copies/μL,批内重复和批间重复的变异系数分别小于3%和5%。结果表明建立的六种病毒单重实时荧光PCR方法具有较好的特异性、灵敏性和重复性。  在建立了六种病毒单重实时荧光定量PCR方法的基础上,进一步建立了可同时检测三种DNA病毒样本即PCV2、PPV、PRV和同时检测三种RNA病毒样本即PRRSV、CSFV、JEV的两组多重实时荧光定量PCR方法。多重实时荧光定量PCR的PCV2,PPV,PRV,PRRSV,JEV和CSFV扩增效率分别达到98%,99%,99%,99%,94%和99%;多重实时荧光定量PCR特异性试验显示非目标病毒均无特异性扩增,PCV2,PRV,CSFV和PRRSV的灵敏度为10 copies/μL,PPV和JEV的灵敏度为100 copies/μL,批内重复和批间重复的变异系数均小于3%和5%。实验结果表明,建立的多重实时荧光定量 PCR方法具有较好的特异性、灵敏性和重复性。  应用建立的多重实时荧光定量 PCR方法对118个样品进行检测,阳性检出率达到38.1%,要稍高于普通PCR的检出阳性率37.3%。多重实时荧光定量PCR检测出了25份PCV2,24份PRRSV,9份PPV和3份PRV阳性样品,其中10份是PCV2和PRRSV混合感染,3份PCV2和PPV混合感染,3份为PCV2、PPV和PRV混合感染。对样品的有效检测表明建立的多重荧光定量 PCR方法可满足实际检测要求,具有较好的实际应用价值,适用于猪呼吸与繁殖障碍性疾病病原的快速检测。
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