目的：通过对临床的相关性研究，观察并分析祛瘀解毒方对血瘀蕴毒型子宫内膜异位症患者的临床症状、体征，相关免疫学指标及在位内膜基质金属蛋白酶-9（MMP-9）表达的影响，将中医血瘀蕴毒理论与西医的发病机制进行结合，为中医药治疗子宫内膜异位症提供新的想法和思路。方法：将70例子宫内膜异位症患者随机分为两组，中药祛瘀解毒方治疗组35例，祛瘀解毒方安慰剂对照组35例，另取35例非子宫内膜异位症患者设为正常人群组。观察治疗组、对照组治疗前后症状、体征改善情况，免疫学指标CA125及IL-6的改变，检测在位内膜MMP-9的表达，并与正常人群组进行比较，统计治疗组、对照组的妊娠率。结果：经过三个月的治疗，治疗组治疗后与治疗前比较，患者月经不调、痛经等中医血瘀蕴毒证候得到有效改善，差异有统计学意义（P<0.05）；血清CA125及IL-6的水平均有所降低，差异均有统计学意义；在位内膜MMP-9的表达得到降低，差异有统计学意义。妊娠率提高至52.63%，较对照组（28.57%）差异有显著性。结论：祛瘀解毒方对于治疗血瘀蕴毒型子宫内膜异位症具有理想的治疗作用，其作用机理可能是通过降低相关因子MMP-9的表达，从而降低子宫内膜细胞在异位种植生长时的粘附、侵袭和血管生成作用，并通过调节患者机体相关免疫，从而减少异位病灶的形成而实现的。