财政作为政府提供基本公共服务的物质基础,在配置公共资源方面发挥着举足轻重的作用,从现阶段财政支出规模来看,上海市公共财政支出占GDP的比重由2011年的21.0%显著增长到2016年的32.3%,政府将更多的公共资源投入到惠及民众的公共服务中。而公共资源的配置,其核心内容是财政支出,基本公共服务的财政支出效率更成为财政支出研究的核心问题,也是服务型政府建设的重要内容。本文从基本公共服务财政支出效率相关理论的分析、效率分析方法的选择入手,通过选取上海市基本公共服务供给的主要方面,同时在公共财政支出中占据较大比重的社会保障、就业、医疗卫生、公共教育、节能环保五类支出,采用三阶段DEA模型分析其财政支出的技术效率、纯技术效率、规模效率及规模报酬所处阶段。其中在第一阶段运用传统DEA方法计算得到未滤除环境因素的初步DEA效率值供第三阶段对比分析,同时计算投入的松弛变量作为第二阶段投入调整的依据;第二阶段中,对投入冗余情况进行分析的同时引入SFA模型重新调整投入变量,剔除人口因素、经济增长因素对公共财政支出效率的影响;第三阶段,在保持产出变量与第一阶段完全相同的基础上,采用第二阶段调整后投入变量,再次计算DEA效率值,综合第一、第三阶段效率值的比较研究发现:社会保障和就业方面的政府投入规模略显不足,创造并维护良好的外部环境可以提高其支出效;外部环境因素削减了公共教育方面的财政支出效率,可通过扩大投入规模并加快提升管理水平来改善;节能环保方面的财政支出规模略显不足,可以考虑继续追加财政投入。在此研究结论的基础上,本文从制度层面、政府层面、社会层面提出了通过改善外部环境来提高效率的建议,又以基本公共服务清单制度入手,从内因上提出提高政府基本公共服务管理水平的新思路。