IL12-IFNγ通路因子基因多态性及表达水平与湖南汉族人群脊柱结核的相关性研究

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第一章,IFNγ、IFNγR、IL12、IL12R基因单核苷酸多态性与脊柱结核的相关性研究  目的:探讨IFNγ、IFNγR、IL12、IL12R基因单核苷酸多态性与脊柱结核易感性的关系。  方法:在2010年12月至2012年12月期间,纳入符合诊断标准的新发脊柱结核患者104例、正常人群106例,应用聚合酶链式反应(PCR)和DNA直接测序法检测两组人群基因多态位点:IFNG:rs2430561;IFNGR1: rs2234711、rs7749390、rs1327474; IL12B:rs3212227; IL12RB1: rs436857、rs393548的单核苷酸基因多态性,统计各等位基因和各基因型频率,分析各位点等位基因及基因型与脊柱结核易感性之间的关系。  结果:1.脊柱结核组中,IFNG rs2430561的A和T两种等位基因频率分别为29.8%、70.2%,脊柱结核组中AA,AT,TT基因型的分布频率分别为10.6%、38.5%、53%,与对照组比较,脊柱结核组等位基因频率(p=0.0242)和基因型分布(p=0.048)存在明显统计学差异,患者组等位基因A和基因型AA比例高于正常人组,表明此位点多态性与脊柱结核的发生相关,A等位基因(OR=1.67,CI=[1.067~2.611])及AA基因型(OR=4.566,95%CI=[1.211~17.210])是罹患脊柱结核的风险因素。2.脊柱结核组中,IFNGR1 rs2234711的C和T两种等位基因频率分别为62.5%、37.5%,CC,CT,TT基因型的分布频率分别为40.4%、44.2%、15.4%,与对照组相比较,rs2234711的等位基因频率(P=0.585)及基因型分布(P=0.799)不存在统计学差异,此位点多态性与脊柱结核的发生无关。3.脊柱结核组中,IFNGR1 rs7749390的T和C两种等位基因频率分别为40.9%、59.1%,脊柱结核组中的TT,CT,CC基因型的分布频率分别为18.3%、45.2%、36.5%,与对照组相比较,rs7749390的等位基因频率(P=0.872)及基因型分布(P=0.921)不存在统计学差异,此位点多态性与脊柱结核的发生无关。4.脊柱结核组中,IFNGR1 rs1327474的A和G两种等位基因频率分别为87.5%、12.5%,AA,AG,GG基因型的分布频率分别为75%、25%、0,与对照组相比较,rs1327474的等位基因频率(P=0.720)及基因型分布(P=0.367)不存在统计学差异,此位点多态性与脊柱结核的发生无关。5.脊柱结核组中,IL12Brs3212227的A和C两种等位基因频率分别为60.1%,39.9%,AA,AC,CC基因型的分布频率分别为34.6%、51%、14.4%,与对照组比较,rs3212227的等位基因频率(P=0.309)及基因型分布(P=0.479)不存在统计学差异,此位点多态性与脊柱结核的发生无关。6.脊柱结核组中,IL12BR1 rs436857的A和G两种等位基因频率分别为15.4%,84.6%,对照组中分别为0.75%,92.5%。脊柱结核组中的GG,AG,AA基因型的分布频率分别为72.1%、25%、2.9%,对照组中三种基因型的分布频率分别为84.9%,15.1%,0%。脊柱结核组等位基因频率(P=0.012)和基因型分布(P=0.035)与对照组相比存在明显统计学差异,患者组等位基因A和基因型AA比例高于正常人组,表明此多态位点与脊柱结核相关,携带等位基因A(OR=2.2272,95%CI=[1.182~4.197])是罹患脊柱结核的风险因素。7.脊柱结核组中,IL12BR1 rs393548的T和A两种等位基因频率分别为88.7%,11.3%,TT,AT,AA基因型的分布频率分别为78%、24%、2%,与对照组比较,两组对象间rs393548的等位基因频率(P=0.443)和基因型分布(P=0.557)不存在统计学差异,此位点多态性与脊柱结核的发生无关。8.IFNGR1 rs2234711 rs7749390 rs1327474三个多态位点经连锁不平衡检测表明:rs223711和rs7749390处在同一个连锁框内,可以进行单倍型分析。rs223711和rs7749390多态位点C-T单倍型是脊柱结核的风险因素(P<0.005,OR=10.838,95%CI=[1.376~85.374])。IL12BR1 rs436857 rs393548两个多态位点经检测不存在连锁不平衡(D=0.854,r2=0.665),不能进行单倍型分析。  结论:  1.IFNG rs2430561基因多态性与脊柱结核发病相关,A等位基因及AA基因型是脊柱结核的危险因素。  2.IL12RB1rs436857基因多态性与脊柱结核发病相关,A等位基因是脊柱结核的危险因素。  3.IFNGR1rs2234711,rs7749390,rs1327474,IL12Brs3212227,IL12RB1rs393548多态位点基因多态性与脊柱结核发病无关。  4.IFNGR1多态位点rs2234711和rs7749390 CT单倍型是脊柱结核的风险因素,携带CT单倍型的人群罹患脊柱结核的风险更高。  第二章,人血清干扰素γ与白细胞介素12表达水平及其影响因素与脊柱结核的相关性研究  目的:探讨血清IFNγ、 IL12浓度与脊柱结核的相关性,探讨血清IFNγ、IL12表达水平与其编码基因多态位点基因多态性的关系。  方法:在2010年12月至2012年12月期间,纳入符合诊断标准的新发脊柱结核患者104例、正常人群106例,应用酶联免疫吸附试验法(ELISA)检测两组人群患者血清IFNγ、IL12浓度,结合已经测得的IFNG、IL12B基因型,探讨血清IFNγ、IL12浓度与脊柱结核之间的相关性以及血清IFNγ、IL12表达水平与其编码基因多态位点基因多态性的关系,分析单核苷酸基因多态性影响脊柱结核发生发展的机制。  结果:脊柱结核组患者血清IFN-γ平均浓度为28.19±8.27pg/ml,对照组血清IFN-γ平均浓度为39.54±10.14 pg/ml,差异有统计学意义(t=-8.89,P<0.001);脊柱结核组患者血清IL12平均浓度为55.11±13.13 pg/ml,对照组血清IL12平均浓度为73.16±15.90 pg/ml,差异有统计学意义(t=-8.967,P<0.001)。血清IFNγ、IL12浓度可以作为临床辅助诊断脊柱结核的血清学指标。IFNG rs2430561 AA基因型可引起血清IFNγ浓度降低;而IL12B rs3212227位点多态性与血清IL12浓度无明显相关性,IL12血清水平降低可能是其它因素造成的。  结论:  1.脊柱结核患者的血清IFN7、IL12浓度低于正常人。  2.IFNG rs2430561 AA基因型可引起血清IFNγ浓度降低;IL12Brs3212227位点多态性与血清IL12浓度无明显相关性。
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