马铃薯晚疫病菌不同生长时期miIRNA let-7对PIK-A基因的调控机制研究

来源 :内蒙古大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:jiansilang2006
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马铃薯晚疫病是由致病疫霉菌iPhytophthora infestans)引起的,可导致马铃薯茎叶死亡和块茎腐烂的一种毁灭性卵菌病害,目前在世界各地马铃薯主产区均有发生,并且造成了巨大的经济损失。近年来,随着对非编码RNA的研究,人们在动植物中发现了一类内源性的、大小约22个碱基的单链非编码RNA—microRNA (miRNA),它主要通过抑制或切割靶基因的方式调节细胞周期及个体发育过程。目前已有晚疫病菌株T30-4全基因组测序、小RNA及RNAi通路的相关报道,但关于P. infestans中的micro-like RNA (milRNA)对靶基因的调控机制还不清楚。本研究基于利用Illumina小RNA高通量测序构建的晚疫病菌株YN-YJ54.1三个生长阶段的小RNA数据库分析,及通过生物信息学预测的1000多个在动植物中比较保守的(?)nilRNAs及其靶基因。选取其中四个milRNAs:let-7, miR1491, miR1498及miR4066-3p为研究对象,通过Northern blot和qPCR对这些milRNAs进行了双重定性及定量检测。通过qPCR和5RACE发现在萌发孢子囊及菌丝中let-7通过不完全互补配对的方式对靶基因PIK-A的mRNA进行切割调控,而在孢子囊中却未发现该调控机制。由于晚疫病菌直接或间接萌发长出牙管是其侵染宿主的必要阶段,因此我们预测该靶基因在P. infestans对宿主的侵染过程中会起到重要作用。此结果可为以后应用分子机制防治马铃薯晚疫病提供科学依据。
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