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真核细胞有丝分裂过程中染色体的动态变化是细胞生物学研究的基本问题之一。虽然人们早就观察到了有丝分裂过程中染色体的这种变化，但对其中所涉及到的蛋白及机制问题只是在近二十年来才陆续有些研究。现已知SMC家族蛋白在染色体的组织、分离过程中扮演了至为关键的角色。但这类蛋白的进化研究相对较少，尤其是在进化地位特殊的原生生物中的情况尚未有研究报道。本文对SMC及其复合体成分在几种原生生物中的存在情况进行了调查，进而对该蛋白在整个原核生物和真核生物中的起源和演化问题进行了探讨。
通过基因组搜索等生物信息学手段，我们鉴定了四种原生生物中的全部的SMC同源序列，并对这些序列进行了分析。结果显示除贾第虫缺少典型的SMC5，锥虫中缺少SMC5、SMC6的同源序列外，其它SMC的同源序列均在这些生物中找到。还发现毛滴虫中SMC同源序列表现出明显的多拷贝现象，其编码序列(ORF)具有明显的核苷酸A偏好性。对这些蛋白进行的二级结构预测显示出一些与高等真核生物有所不同的特征，尤其是贾第虫中的SMC蛋白更表现了独特的二级结构特征。这些特点可能与这些生物核分裂过程中某些独特的染色体动态变化特征相关联。对与SMC形成复合体的蛋白在这些生物中的存在情况也做了调查，发现它们在这些生物中只有小部分存在。这表明由SMC组成的“SMC/Kleisin/non-SMC＆ Kleisin”复合体在这几种生物可能较为简单或者在非SMC亚基方面有较大的分化。
为了进一步研究与形成典型中期染色体密切相关的两种蛋白SMC2和TopoII在未发现凝聚染色体的贾第虫中的功能，本文还对贾第虫的这两个基因进行了原核表达载体的克隆构建和表达。成功构建了重组质粒，并在相应的菌种中得到了大量的包涵体表达。经过纯化进行兔子免疫制备出了抗血清，为后续研究这两种蛋白在贾第虫细胞周期中的定位分布和贾第虫的核分裂打下了基础。
最后，我们对SMC及同功蛋白MukB在原核中的存在情况以及它们与真核生物SMC的分子系统关系进行了系统研究。发现MukB及其组成的复合体仅存在于γ蛋白菌中的Enterobacteriale、Pasteurellaceae和Vibrionaceae中，且在物种间非常保守，应是较晚时期进化形成的；衣原体类、α蛋白菌中的立克次氏体、e蛋白菌中没有任何SMC或MukB同源序列，也没有与其形成复合体的蛋白。由于这些原核生物均为高度寄生菌，推测应该是由于寄生完全丢失了这类蛋白，而利用宿主的相应装置完成对自身基因的组织。分子系统分析的结果显示MukB与SMC距离较远，不是同源蛋白，应是趋同进化的结果。真核的SMC与原细菌SMC距离最近，应有最近的共同祖先。