本研究以发展基于二维CE 技术的复杂蛋白质分离方法为目标,采用特殊设计的中空纤维型接口,构建了2D CIEF-CGE 和2D CIEF-CZE 分离平台。在2D CIEF-CGE 分离平台上对血红蛋白异构体加以研究,采用动态聚焦和反向EOF 技术构建的2D CIEF-CZE 分离平台也被用于核糖核酸酶研究,展示了新型2D 分离系统独特的浓缩作用及高分离能力。通过对具有极端等电点蛋白质在pH 梯度中的电泳情况的综合考察,采取“预建梯度+部分进样”技术建立了一种新型CE 分离模式—“pH 梯度驱动电泳”(PGDE,pH gradient driving electrophoresis)。对蛋白质在PGDE 中输运特征加以理论研究,并结合CIEF 方法分离鸡卵清蛋白样品的实验结果,指出了完善具有极端等电点蛋白质分离分析方法的可能策略。为了克服等电聚焦缓冲溶液中添加载体两性电解质导致的缺陷,制备了“整体柱型固定化pH 梯度”(M-IPG,monolithic immobilized pH gradient),为改善CIEF 的分离度、检测器匹配性提供了可能的研究手段。M-IPG 用于CIEF 实验,得到了与自由溶液聚焦相类似的实验结果,显示出较高的分辨率(<0.01pH 单位)及良好的分离性能。将发展的方法应用于实际样品鹿茸冻干粉提取液和鼠肝癌细胞提取液的分离,得到较好的结果。