随着我国高等教育体系的逐步完善,政府对高等院校的投入不断增加,如何充分利用下拨资金成为高等院校关注的主要问题,预算管理工作作为财务管理工作中的主要内容模块受到高校越来越多的关注。当前我国高校的预算编制仍处于低水平状态,预算编制不准确、不精细;且在预算执行中没有相应的监督预警机制,导致预算执行力差。为使高校预算管理更加科学、合理,考虑将数据挖掘技术应用于高校预算管理工作中,通过一套规范、高效的预算管理系统辅助财务工作者全面有效地管理预算业务。首先,针对高校预算管理系统中预算编制模块存在的问题,提出改进关联规则挖掘算法,对往年预算数据的不同维度进行频繁模式挖掘,准确预测各项预算的数值和比例,完成对预算编制的智能预测。其次,针对预算执行模块中监督预警机制缺失的问题,提出一种改进ID3增量式学习决策树算法,在预算执行过程中结合递增式学习与决策树构造算法,构建预警决策树,完成对预算执行情况预警分析。最后,针对预算数据采集中来自各业务系统的数据不一致的问题,引入数据预处理技术,通过数据集成、清洗、变换以及简化等实现数据统一口径,便于功能模块之间数据的交互,并且为其他相关系统的接入减少工作量。本文中高校预算管理系统采用C#语言编写,系统测试表明本文实现的系统符合规范化管理与扩展需求,能更好地提高预算编制的准确度以及完成预算进度的预警分析,辅助高校的预算管理工作。