在诞生20年左右的时间里(见附录1),分子系统学<*>的发展极为迅速.该论文工作中应用了世界上这一学科前沿领域研究进展中的2个方面——①在分子序列信息的挖掘上,分子高级结构信息的价值受到越来越多的重视,对于RNA(尤其是RNA)而言,其二级结构信息既可以用于校正由软件分析所得的核苷酸(碱基)的位置同源信息,也可以直接用于支序分析;②应用贝叶斯推断进行系统发育重建的尝试在2002-2003年迅速走向应用.工作中十分初步地涉及了线粒体基因组和超级树技术的内容——生物学整体研究业已步入基因组时代,线粒体基因组由于规模小、结构简单、相对易于研究,正在成为动物系统发育研究中的首选分子标记之一;超级树技术自1986年被提出以来逐渐成熟,从20世纪90年代中期开始在部分哺乳类、鸟类、恐龙(化石)、锥虫以及植物和原核生物等类群中已得到应用,这一技术能够最大程度整合不同层次系统发育信息,对于描述性系统学、进化模型、进化模式<**>、支系形成速率以及生物多样性、保护生物学与进化生物学等多方面研究都有重要意义.此外,①近年来优化方法与大型计算的兴起成为分子系统学研究中的一个亮点,②主成分分析在结合个体发育信息进行形态特征支序分析研究中的应用逐渐增多;该文对这两个方面的进展仅做了介绍.该论文工作对与异翅亚目长蝽总科这一支系相关的目级、科级阶元进行了以18S rDNA为分子标记的分子系统发育研究,主要包括①广义异翅类在真半翅目中的系统发育地位和18SrRNA全长二级结构中长度变异区的分析以及补偿性替换与准补偿性替换的分析;②异翅亚目蝽次目毛点类长蝽-红蝽-缘蝽复合体内部科间系统发育关系和18S rRNA部分片段中长度变异区和补偿性替换的分析;③长蝽总科内部科级阶元间系统发育关系与结合已有研究结果的超级树的构建.在国际同领域研究中,①该项论文工作首次将贝叶斯分析应用到真变态类昆虫的系统发育研究中,并以MP、ME、ML和贝叶斯分析4种算法的合意结果支持了广义异翅类的姊妹群是盾喙类,而不是古喙类;②最先独立定位了胸喙类18S rRNA长度高变区的位置并提出这些变异区位于茎环结构靠近端部的区域;③首次提出AC配对在准补偿性替换中具有重要作用,各种碱基配对在RNA二级结构中的重要性排序应为"经典配对>GU>AC>其它配对";④首次用分子系统学的方法对"毛点类-长蝽总科"支系相关的科级阶元系统发育进行了研究,得到了具有较为清晰进化规律的结果;⑤最先独立提出比较完整的蝽类昆虫进化主干类群的地栖性假设.