论文部分内容阅读
【目的】:
1.研究lncRNA在急性缺血性卒中的发生过程中表达的变化情况。
2.探讨lncRNA是否对急性缺血性卒中具有诊断潜能。
3.探讨lncRNA与急性缺血性卒中起病时的严重程度的关系。
4.探讨lncRNA与急性缺血性卒中近期(起病后90天)预后的关系。
【方法】:
本研究分为两个阶段,第一阶段运用RNA高通量测序技术(high-throughputRNAsequencingtechnology)筛选显著高表达的lncRNA(LongnoncodingRNA)。我们随机选择3例起病48小时内,NIHSS评分15分及以上的首发缺血性脑卒中患者作为病例组,入院时抽外周血4ml,病情稳定时再抽4ml,同时随机选择3例健康者作为对照组,分别提取外周血中单个核细胞,通过高通量测序技术找到显著差异表达的若干个lncRNA作为目标lncRNA。第二阶段为大量样本验证阶段。目前我们入选中国粤西地区37例缺血性卒中患者和14例健康对照者,入院时抽血4ml,提取外周血单个核细胞,并运用实时定量PCR(real-timePCR)检测目标lncRNA的表达水平。同时收集患者入院NIHSS评分,TOAST分型以及90天mRS评分等临床资料。采用生物信息学软件对差异表达的lncRNA进行GO和KEGG分析。采用SPSS20、GraphPadPrism5统计软件对上述资料进行统计分析,探讨目标lncRNA与缺血性卒中的诊断、病情严重程度以及预后的相关性。
【结果】:
1.在第一阶段高通量测序中,共发现191个lncRNA显著差异表达,其中66个lncRNA显著下调,125个lncRNA显著上调。在显著差异表达的lncRNA中,有9个为新发现的lncRNA。通过对测序结果的分析,我们在显著差异表达的lncRNA中初步选择了5个lncRNA进行第二阶段的验证实验。
2.GO分析和KEGG分析结果提示:差异表达的lncRNA可能与氧化磷酸化、RNA转运、细胞周期、络氨酸肌酶结合、甲状腺激素合成等生物过程相关,并可能参与多条信号通路,如β-丙氨酸代谢、轴突导向、赖氨酸生物合成、核苷酸切除修复、坏死性凋亡、肌动蛋白细胞骨架调节通路等。
3.在第二阶段的验证实验中,LncRNAENST00000588439的表达水平在急性缺血性卒中患者中显著升高(P<0.01)。
4.在急性缺血性卒中患者中,不同的病情(重度与非重度),90天不同的预后以及TOAST分型(LAA组与CE组),LncRNAENST00000588439的表达水平均显著升高(P<0.01)。
5.Logistic回归矫正危险因素后分析结果提示糖化血红蛋白是缺血性卒中的独立危险因素。
【结论】:
1.LncRNA可能在急性缺血性卒中的发病过程中起着重要的调控作用。
2.LncRNAENST00000588439具有作为急性缺血性卒中临床诊断生物学标志物的潜能。
3.LncRNAENST00000588439在急性缺血性卒中患者发病过程中可能具有重要的调控功能。
4.Logistic回归分析结果提示糖化血红蛋白是缺血性卒中的独立危险因素。
1.研究lncRNA在急性缺血性卒中的发生过程中表达的变化情况。
2.探讨lncRNA是否对急性缺血性卒中具有诊断潜能。
3.探讨lncRNA与急性缺血性卒中起病时的严重程度的关系。
4.探讨lncRNA与急性缺血性卒中近期(起病后90天)预后的关系。
【方法】:
本研究分为两个阶段,第一阶段运用RNA高通量测序技术(high-throughputRNAsequencingtechnology)筛选显著高表达的lncRNA(LongnoncodingRNA)。我们随机选择3例起病48小时内,NIHSS评分15分及以上的首发缺血性脑卒中患者作为病例组,入院时抽外周血4ml,病情稳定时再抽4ml,同时随机选择3例健康者作为对照组,分别提取外周血中单个核细胞,通过高通量测序技术找到显著差异表达的若干个lncRNA作为目标lncRNA。第二阶段为大量样本验证阶段。目前我们入选中国粤西地区37例缺血性卒中患者和14例健康对照者,入院时抽血4ml,提取外周血单个核细胞,并运用实时定量PCR(real-timePCR)检测目标lncRNA的表达水平。同时收集患者入院NIHSS评分,TOAST分型以及90天mRS评分等临床资料。采用生物信息学软件对差异表达的lncRNA进行GO和KEGG分析。采用SPSS20、GraphPadPrism5统计软件对上述资料进行统计分析,探讨目标lncRNA与缺血性卒中的诊断、病情严重程度以及预后的相关性。
【结果】:
1.在第一阶段高通量测序中,共发现191个lncRNA显著差异表达,其中66个lncRNA显著下调,125个lncRNA显著上调。在显著差异表达的lncRNA中,有9个为新发现的lncRNA。通过对测序结果的分析,我们在显著差异表达的lncRNA中初步选择了5个lncRNA进行第二阶段的验证实验。
2.GO分析和KEGG分析结果提示:差异表达的lncRNA可能与氧化磷酸化、RNA转运、细胞周期、络氨酸肌酶结合、甲状腺激素合成等生物过程相关,并可能参与多条信号通路,如β-丙氨酸代谢、轴突导向、赖氨酸生物合成、核苷酸切除修复、坏死性凋亡、肌动蛋白细胞骨架调节通路等。
3.在第二阶段的验证实验中,LncRNAENST00000588439的表达水平在急性缺血性卒中患者中显著升高(P<0.01)。
4.在急性缺血性卒中患者中,不同的病情(重度与非重度),90天不同的预后以及TOAST分型(LAA组与CE组),LncRNAENST00000588439的表达水平均显著升高(P<0.01)。
5.Logistic回归矫正危险因素后分析结果提示糖化血红蛋白是缺血性卒中的独立危险因素。
【结论】:
1.LncRNA可能在急性缺血性卒中的发病过程中起着重要的调控作用。
2.LncRNAENST00000588439具有作为急性缺血性卒中临床诊断生物学标志物的潜能。
3.LncRNAENST00000588439在急性缺血性卒中患者发病过程中可能具有重要的调控功能。
4.Logistic回归分析结果提示糖化血红蛋白是缺血性卒中的独立危险因素。