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以两种野生番茄秘鲁番茄(Lycopersicon peruvianum LA111)、潘那利番茄(Lycopersicon pennellii LA716)和栽培番茄“鲜丰98-7”(Lycopersicon esculentum Mill‘XF 98-7’)为材料进行蛋白质组分析。番茄幼苗生长至“两叶一心”时用150mM NaCl胁迫,14天后用TCA丙酮法提取叶片总蛋白,经过裂解、水化、等电聚焦、平衡、SDS-PAGE电泳和考马斯亮蓝胶体染色等一系列步骤后,获得双向电泳凝胶图。经ImageMaster 2D patinum软件分析,匹配率均达90%以上,图像分辨率也超过800个蛋白斑点。软件分析和肉眼观察表明,秘鲁番茄、潘那利番茄、鲜丰番茄分别有16、15、28个蛋白为上调蛋白,11、18、17个蛋白为下调蛋白。选取其中差异最显著的20个蛋白点进行MALDI-TOF分析和数据检索,其中17个蛋白得到了有效的搜库结果。结果表明,在秘鲁番茄中,碳酸酐酶、苏氨酸脱水酶、铁氧还蛋白-NADP+还原酶表达下调;监护蛋白60β亚基、α-微管蛋白和2-酮戊二酸双加氧酶(过氧化物酶)同源物表达上调。在潘那利番茄中,几丁质酶表达上调,磷酸甘油酸激酶表达下调。在鲜丰番茄中,除S-腺苷甲硫氨酸合成酶表达下调以外,1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶大亚基、抗坏血酸过氧化物酶、ATP酶α亚基和尿苷三磷酸-葡糖-1-磷酸尿苷酰转移酶均表达上调。这些差异蛋白涉及植物的光合作用、离子区隔化、能量转换、细胞结构等。结合已报道其他植物中这17种蛋白的功能,对番茄耐盐机制进行初步探讨。利用聚丙烯酰胺凝胶电泳方法,对5份不同盐敏感型番茄材料进行POD同工酶分析。结果表明,在受到150mM NaCl胁迫后的72h内,2份敏盐番