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“第二代燃料乙醇”原料预处理中产生的的盐，如乙酸钠、氯化钠对运动发酵单胞菌(Z.mobilis)的抑制是乙醇发酵中的重要限制因素，是Z.mobilis实现乙醇发酵工业化的瓶颈之一，增强Z.mobilis对盐的耐受性是突破限制因素的有效途径。本课题主要研究NaCl对Z.mobilis生理生化、乙醇合成途径中关键酶的活性影响，及菌体对盐胁迫的应激反应特性，全面分析盐对菌体生理生化及乙醇发酵的影响，初步确定一些相容性物质、抗氧化剂、ATPase以及一些离子在抗盐胁迫中的作用。
分析NaCl胁迫下Z.mobilis232B生理生化特征，揭示Cl-比Na+对细胞的毒害作用大。菌体的比生长速率和最大生物量都显著降低;菌体形态发生变化，呈纤维丝状是正常菌体长度的3-5倍;菌体细胞膜受损，膜通透性显著增大，胞内离子、蛋白质和核酸外泄;菌体胞内离子动态平衡被打破，K+大量外流，Na+大量内流;葡萄糖消耗速度和乙醇合成量均显著降低。
分析NaCl对Z.mobilis232B菌体形态的影响，揭示Cl-干扰菌体的正常分裂，导致菌体分裂受阻，子细胞无法从母细胞上分裂下来，从而导致菌体长度不断增长，最终呈纤维丝状，但这种抑制作用是可逆的;Cl-对菌体的作用靶点，主要是干扰菌体参与细胞分裂的蛋白的合成或抑制其活性，从而影响菌体的正常分裂。
分析NaCl胁迫下Z.mobilis232B乙醇合成途径中关键酶的活性，结果表明，葡萄糖激酶、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶、丙酮酸脱羧酶和乙醇脱氢酶的活性显著降低，而异柠檬酸脱氢酶和苹果酸脱氢酶活性显著增加。这揭示了代谢网络中进入乙醇流向的相关途径中的通量降低而进入TCA途径的碳素流量增加，从而不利于乙醇的合成。
NaCl胁迫下Z.mobilis232B主要积累可溶性糖、游离氨基酸、蛋白质作为渗透保护剂，胞内抗氧化能力显著增强。外源添加渗透压调节物质和抗氧化剂，可有效改善菌体盐耐受性，菌体生长速度和生物量显著增加。
通过比较盐敏感和盐耐受Z.mobilis的ATPase活性和抑制ATPase活性，揭示了Na+-K+-ATPase、Ca2+-ATPase及H+-ATPase在抵抗盐胁迫中发挥的重要作用，Na+-K+-ATPase、Ca2+-ATPase及H+-ATPase活性的增强促进菌体的生长，增强菌体盐耐受性。外源添加K+、Ca2+和Mg2+可有效缓解NaCl对细胞的毒害，促进菌体的生长。