晚清海关自外籍税务司制度建立以后，引起了晚清社会的深刻变革，在管理上给古老衰迈的封建肌体里注入了新鲜的血液。海关管理引进了西方先进的行政管理经验，由此造成了海关组织结构、运行机制、管理模式的变化。在海关人事管理、海关财务管理、海关事务管理等方面，采用了不同于封建旧海关的管理措施，取得了良好的管理效果，清政府的关税收入也随之增加，成为晚清政府财政收入的主要来源之一。同时，晚清海关所倡导和经办的一些洋务，也因为海关管理的科学化、制度化、海关人员工作的高效率，为其开办洋务提供了良好的管理基础。海关管理的良好绩效为晚清政府推行的三次政治体制改革提供了可资借鉴的行政管理经验。如在改革中推行精减机构、整顿吏治、刷新纲纪等。在洋务派经营的洋务企业中，海关管理的经验和方法也被洋务派运用到洋务企业的经营管理上，如募用懂技术、善管理的外国人帮办洋务，借鉴海关的管理方法制订企业经营管理的规章制度等，都取得了明显的效果。晚清铁路的经营管理模式也受到海关管理的影响，在铁路管理机构、铁路人事、铁路财务等方面都可看到海关管理经验对它的作用与影响。由此可见，海关行政管理对促进管理现代化的作用是较大的。