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无序蛋白质是一种新型蛋白质,在天然状态并不具有稳定的三维结构,但是仍具有生物活性,这是对传统蛋白质“序列-结构-功能”范式的挑战。在天然条件下,无序蛋白质是多种构象共存、不断实现动态变化的系综,这种结构特征使得无序蛋白质在细胞信号传导、分子识别等各种生命活动中扮演重要角色。深入研究无序蛋白质,将促进人们更好地认识对蛋白质结构与功能之间的关系。 尽管在蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA相互作用中,采用生物信息学方法,对蛋白质的无序性与功能之间的关联性研究越来越多,但是在蛋白质-RNA相互作用中仍然相对很少。在这里,开展了这方面的研究,主要工作分为两个部分。第一部分是对人类基因组中RNA结合蛋白质的无序性及无序性与磷酸化位点的相关性进行分析。结果显示RNA结合蛋白质中的无序残基含量更高,具有更多的无序尾端,并且RNA结合蛋白质中的57.52%磷酸化位点位于无序残基上,跟DNA结合蛋白质相近,高于非RNA结合蛋白质。第二部分是研究PDB数据库中具有磷酸化位点信息的RNA结合蛋白质的无序性、磷酸化作用对蛋白质-RNA结合的影响。结果表明RNA结合蛋白质上的无序残基趋向位于蛋白质-RNA结合界面之外的区域,磷酸化位点趋向位于结合界面上,但在该数据集中磷酸化位点与无序位点并不具有相关性。 最后,为了更好的研究蛋白质-RNA相互作用,还构建了一个基于结构的蛋白质-RNA亲和力常数数据集,并用于蛋白质-RNA对接打分函数的评估。这一数据集将有利于促进蛋白质-RNA对接和结合机制的研究。