马铃薯淀粉合成酶Ⅲ基因cDNA的克隆及RNA干扰载体的构建

来源 :甘肃农业大学 | 被引量 : 7次 | 上传用户:sayaka66
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淀粉是植物通过光合作用产生的一种多糖高分子化合物。马铃薯块茎中淀粉含量一般占其鲜重的9%~25%,是仅次于玉米淀粉的生产量和商品量而居第二位的植物淀粉。目前,生产上推广的马铃薯品种,其淀粉糊化温度、粘度、冻融稳定性都不太理想。本研究将通过RT-PCR技术扩增马铃薯可溶性淀粉合成酶III(SSIII)基因的cDNA序列,然后通过RNA干扰技术抑制该基因的表达,以改变淀粉的结构,提高淀粉中共价磷酸的含量,培育出更适合于加工业的马铃薯新品系(种);同时,应用RNA干扰这种反向遗传学手段,研究SSIII基因的功能,及SSIII在淀粉合成中的作用和淀粉合成的机理。取得的主要研究结果有:1.通过RT-PCR技术克隆了SSIII基因的cDNA,序列分析表明该cDNA片段全长为3967 bp,开放阅读框3693 bp,编码1230个氨基酸。核酸序列同源性分析表明,该基因与GenBank中已登记的SSIII基因(X94400)的同源性高达99%;氨基酸序列与SSIII基因(X94400)编码蛋白(CAA64173.1)的同源性高达98%。2.SSIII蛋白的生物信息学分析表明,该蛋白质具有多个磷酸化位点,没有跨膜区;蛋白质二级结构预测显示,有369个氨基酸可能形成α-螺旋结构,249个氨基酸可形成β折叠,102个氨基酸可形成β转角,510个氨基酸可形成无规则卷曲;功能结构域预测显示,有3个重复的SSIII家族序列,1个淀粉合成酶保守催化结构域;通过亚细胞定位可知,它是一种含有75个氨基酸的叶绿体转运肽蛋白。3.构建了SSIII基因的RNA干扰中间载体,用RNAStructure软件分析表明该构建物能形成发夹结构,能够引发生物体内的RNA干扰机制;通过BLAST比对表明此干扰片段能够特异的抑制SSIII基因的表达。分别构建了组成型启动子CaMV 35S和块茎特异表达启动子CIPP驱动的SSIII基因的RNA干扰表达载体,通过冻融法转化根癌农杆菌获得了转化子,为进一步马铃薯的遗传转化奠定了基础。
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