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本文通过基质辅助飞行时间质谱法(MALDI-TOF MS)和液质联用法(LC-MS/MS)探究其鉴别羊绒羊毛的可行性,找出了该方法下羊绒等蛋白质纤维最佳工艺条件和质谱检测条件。结果表明:1.还原法结合酶法的提取羊绒羊毛角蛋白的最佳工艺为:二硫苏糖醇浓度为1.0mol/L,尿素浓度为7mol/L,碘乙酰胺浓度为1mol/L,温度为37℃。2.本研究应用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱仪在相同的实验条件下,所测羊绒提取多肽在质荷比为2691.3处有特征峰值,经质谱网络数据库检索得出其氨基酸排列顺序为:YSCQLNQVQSLIVNVESQLAEIR(每个大写字母代表一种氨基酸,如Y代表酪氨酸)。所测羊毛提取多肽在质荷比2664.5处有特征峰值,经质谱网络数据库检索得出其氨基酸序列为:YSCQLSQVQSLIVNVESQLAEIR。即在羊毛中是S(丝氨酸)的位置,在羊绒中变成了N(天冬酰胺),据此可以进行羊绒和羊毛的鉴别。3.通过探究天然白羊绒、脱鳞片后羊毛、天然白羊毛、拉伸羊毛四种材料的提取蛋白差异,可以看出天然羊绒与天然羊毛蛋白之间存在明显差异,有多个质谱峰不同,可见质谱法进行羊绒羊毛的鉴别是可行的。同时,脱鳞片、拉伸等手段不影响质谱法测试结果,质谱法是可靠、客观的检测方法。4.通过探究磨碎处理是否对测试结果有影响,可以得出磨碎处理并不能破坏质谱所能检测到的蛋白差异部分的结论,则在后期进行羊绒羊毛定量测试中,可采用磨碎的方式使二者混合更加均匀,减小实验误差。5.通过羊绒与羊毛1:1混合后经质谱分析,可以看出特征峰2691荷质比仍旧存在,二者混合不干扰该特征峰,则后期研究可用该特征峰强度作为定量的依据。6.用LC-MS/MS羊绒、羊毛、绵羊绒均检测到特有的多肽序列。三者前处理过程完全一致,二硫苏糖醇仅破坏毛纤维的二硫键,而胰蛋白酶也具有特异性,经检测后三者具有各自特有的多肽序列说明三者蛋白质结构具有本质区别,从这一点上讲,三者属于完全不同的毛纤维。若从这些特有的多肽序列中选取特征序列作为羊绒羊毛检测的依据,则完全可以精确客观高效的完成羊绒羊毛纤维的定性检测。本文将蛋白质组学的最新理论成果与技术创新,大胆运用到动物纤维的鉴别和检测中,期望在羊绒特征蛋白的获取和蛋白质特征图谱的建立方面做出开创性的工作。