生物钟是指机体内节律性的活动,能使机体维持持续而恒定的规律变化,即使外界条件变化也能保持恒定。机体的主要控制生物节律的器官在下丘脑,但外周组织也具有昼夜节律,例如肌肉。鱼肌纤维类型与人体相似,分为主要负责代谢的快肌和主要进行有氧运动的慢肌,哺乳动物的两种肌纤维是嵌合式,白肌纤维和红肌纤维交叉散漫分布,难分离,而鱼类的快慢肌很有特色,易完全分离。目前对于肌肉生物钟的研究也比较少。本论文对从鳜红肌筛选到的15个时钟基因(arntl1、arntl2、clock、cry1、cry2、cry3、cry-dash、 npas2、nr1d1、nr1d2、per1、 per2、per3、Rora和tim),将所有时钟基因进行系统进化树发现,在硬骨鱼类的时钟基因与其他鱼类的亲缘性较近,序列相对保守,也证明了转录组库内时钟基因序列及功能预测的准确性。快肌中,时钟基因arntl1、arntl2、clock、cry1、nr1d1、 nr1d2、per1、per2、per3和Rora,功能基因mbnl1、mrf4、mstn、myoD、myoG、 myf5和Jpena有昼夜节律性。节律性时钟基因之间有正相关性,也有负相关性。功能基因pena与arntl2, cry1和per1负相关。mbnl1与arntl2、cry1、nr1d1、per2和per3有强的正关联。myoG也与arntl2和per2强正相关。在慢肌中,时钟基因arntl1、 arntl2、clock、cry1、cry3、npas2、nr1d1、per1、per2、Rora和tim,功能基因foxk2、 mrf4、mstn、myf5和pena有昼夜节律性。节律性的时钟基因之间只有正关联,并没有负关联。pena与arntl2, cry1和per1呈中度正相关。myf5, mrf4, pcna和mstn在慢肌表现出与cry3和npas2很强的相关性。肌肉功能基因foxk2也显示出与正调控因子arntl2有很强的相关性。结果显示不管是在快肌还是慢肌中,多基因之间都有强关联性,这些时钟基因与肌肉的功能基因互相协调和拮抗其功能,共同对鳜的肌纤维生长代谢和生物钟调控,这也对于进一步研究他们之间的作用关系提供了依据。