RNA-Seq解析毒力抑制剂弱化水稻细菌性褐条病菌致病力的机制

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水稻细菌性褐条病菌(Acidovorax oryzae)广泛存在于我国水稻种植区,通过带菌的水稻种子传播,可造成水稻减产及严重的经济损失。本研究在本实验室之前研究发现水稻细菌性稻褐条病菌菌株RS-1具有氨苄青霉素(后简称Amp)抗性的基础上,首先测试Amp处理对菌株RS-1的致病性、游动性、生物膜形成、胞外多糖和定殖作用等毒力相关特性,以及对菌株的效应蛋白的表达和分泌的影响。然后比较分析Amp处理和未处理条件下褐条病菌的RNA-Seq数据并分析基因在转录组水平上的表达差异;构建基因敲除突变体并测定其致病性等毒力相关表型、测定突变体菌株的效应蛋白的表达和分泌情况等,进一步探究Amp对褐条病菌作用的潜在机制。结果显示Amp处理的菌株RS-1的包括游动性、致病性和定殖能力等毒力相关特性被显著弱化,但其生长和生物膜的形成未受影响;根据转录组分析结果推断,菌株RS-1的弱化的毒力可能和被Amp特异诱导表达的685个基因、被Amp特异抑制表达的89个基因以及参与毒力和抗性相关的生理生化或代谢途径的差异表达基因有关;hcp基因在Amp(+)条件下转录水平的表达量显著下调以及六型分泌系统(T6SS)的效应蛋白Hcp在Amp(+)条件下分泌量显著减少,都说明Amp显著的影响hcp基因的转录和蛋白表达;构建的△hcp突变体和经过Amp处理的野生型菌株RS-1的致病性、游动性、胞外多糖和生物膜形成能力等毒力相关表型相似,说明Amp和菌株RS-1中的Hcp蛋白可能存在某些联系;最后,本研究通过蛋白互作研究证实Hcp蛋白与部分其它T6SS组分和效应蛋白VgrG存在互作关系,充分证实了hcp在T6SS中的重要地位,进而推断以hcp为代表的T6SS可能和Amp具有某些联系以及在褐条病菌被Amp弱化毒力的过程中扮演了重要的角色。综上所述,本研究明确了Amp显著弱化了褐条病菌对水稻的毒力及hcp为代表的T6SS在毒力弱化作用中可能扮演着重要的角色,从一个新的角度揭示了褐条病菌的致病机制。针对目前我国农业环境中的抗生素污染日趋严重,这一结果对于根据病原细菌数量来开展高效的病害预测预报工作有着重要的意义。
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